199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0338 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  100 
 
 		 446 aa  924    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.95 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.94 
 
 		 444 aa  266  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.94 
 
 		 442 aa  259  7e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.98 
 
 		 443 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.61 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.59 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.87 
 
 		 467 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.5 
 
 		 467 aa  256  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.74 
 
 		 408 aa  253  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  35.34 
 
 		 397 aa  249  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.29 
 
 		 449 aa  247  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.61 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.65 
 
 		 430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.75 
 
 		 439 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.6 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.28 
 
 		 446 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.25 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5283  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.93 
 
 		 450 aa  193  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.43 
 
 		 397 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.77 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.15 
 
 		 385 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.15 
 
 		 385 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.04 
 
 		 385 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.89 
 
 		 419 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.52 
 
 		 419 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.52 
 
 		 419 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.02 
 
 		 419 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4421  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.18 
 
 		 452 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  29.67 
 
 		 415 aa  169  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.77 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  28.18 
 
 		 389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.52 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.01 
 
 		 420 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.89 
 
 		 419 aa  162  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.01 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.28 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.18 
 
 		 419 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2479  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.45 
 
 		 449 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3884  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.45 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.383079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.63 
 
 		 439 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.07 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  30.43 
 
 		 405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.09 
 
 		 419 aa  141  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.68 
 
 		 430 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  29.49 
 
 		 446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  25.77 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.33 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  30.23 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  28.91 
 
 		 431 aa  131  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.72 
 
 		 425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.87 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  26.65 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  29.74 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.97 
 
 		 387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  26.07 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  26.8 
 
 		 416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  26.3 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  24.74 
 
 		 414 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  24.8 
 
 		 396 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  26.01 
 
 		 450 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  27.58 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  25 
 
 		 414 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  23.34 
 
 		 404 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  28.48 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  23.18 
 
 		 505 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  25.42 
 
 		 421 aa  92.8  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  26.07 
 
 		 413 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  25 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  24.73 
 
 		 640 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  21.88 
 
 		 371 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  22.82 
 
 		 505 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  22.04 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1842  hypothetical protein  26.13 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  24.18 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  22.83 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2115  Beta-lactamase  20.37 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269149  normal  0.194976 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  25 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  25 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  22.83 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  25.07 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  22.22 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  23.81 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  21.97 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  23.81 
 
 		 503 aa  75.5  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  22.71 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  24.27 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  23.21 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  23.21 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  23.08 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  24.37 
 
 		 473 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  23.08 
 
 		 315 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  24.37 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  24.37 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  22.84 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  22.49 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  22.82 
 
 		 530 aa  69.7  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  23.73 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  23.03 
 
 		 475 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  23.23 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>