More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1793 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  100 
 
 		 408 aa  818    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  50.49 
 
 		 445 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  49.37 
 
 		 444 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  44.85 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  48.77 
 
 		 452 aa  388  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  48.12 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  47.62 
 
 		 467 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  47.39 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  44.5 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  47.36 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  42.75 
 
 		 448 aa  351  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  45.99 
 
 		 446 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  44.14 
 
 		 449 aa  345  8.999999999999999e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  44.31 
 
 		 442 aa  325  6e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  43.34 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  39.01 
 
 		 410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.74 
 
 		 446 aa  253  6e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.46 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.51 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.59 
 
 		 420 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.81 
 
 		 419 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.82 
 
 		 439 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5283  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.31 
 
 		 450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4421  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.51 
 
 		 452 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.33 
 
 		 419 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.81 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.81 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.33 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.81 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.13 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  33.52 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.41 
 
 		 419 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.33 
 
 		 419 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.05 
 
 		 419 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  33.15 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.29 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.29 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.43 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.56 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3884  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.93 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.383079 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.94 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  30.87 
 
 		 389 aa  150  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  30.09 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.9 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.57 
 
 		 419 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2479  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.29 
 
 		 449 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.84 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  29.17 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  30.67 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  29.95 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.49 
 
 		 425 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  25.62 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  26.25 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.87 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.78 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  29.38 
 
 		 414 aa  123  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  30.98 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  26.68 
 
 		 413 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  28.93 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  28.49 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  27.56 
 
 		 426 aa  116  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  30.84 
 
 		 410 aa  116  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  28.23 
 
 		 431 aa  113  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  25.07 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  27.36 
 
 		 505 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  27.42 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  30.93 
 
 		 396 aa  97.1  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  28.35 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  27.89 
 
 		 530 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  23.16 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  29.68 
 
 		 417 aa  87  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  30.03 
 
 		 640 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  28.19 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  25.19 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  25.19 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  28.48 
 
 		 524 aa  84  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  26.05 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  28.3 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  28.38 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  27.59 
 
 		 530 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  26.76 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  29.23 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  26.59 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  28.24 
 
 		 359 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  25 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  27.91 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  28.67 
 
 		 503 aa  73.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  27.01 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  26.58 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.4 
 
 		 476 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  26.25 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  27.59 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  24.6 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  26.43 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  27.39 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  24.92 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  27.42 
 
 		 473 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  22.59 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  27.42 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  27.39 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>