More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0215 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  100 
 
 		 419 aa  860    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  43.86 
 
 		 425 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  35.17 
 
 		 412 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  36.47 
 
 		 389 aa  202  9e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  38.12 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.46 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  36.68 
 
 		 390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.88 
 
 		 449 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  32.25 
 
 		 395 aa  195  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  33.9 
 
 		 505 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  33.33 
 
 		 405 aa  187  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  34.72 
 
 		 405 aa  183  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  41.59 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  31.01 
 
 		 413 aa  176  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  30.46 
 
 		 414 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  31.55 
 
 		 414 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  31.49 
 
 		 447 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  34.98 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  34.98 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.13 
 
 		 442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.54 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  35.74 
 
 		 410 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  35.91 
 
 		 404 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  29.3 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30 
 
 		 467 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.17 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.42 
 
 		 467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  32.53 
 
 		 417 aa  153  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33 
 
 		 443 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  31.8 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.98 
 
 		 397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.89 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  30.52 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  31.2 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.45 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  31.36 
 
 		 384 aa  143  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  32.14 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.43 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.27 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  29.69 
 
 		 397 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.22 
 
 		 446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.57 
 
 		 408 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.78 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.38 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.62 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.38 
 
 		 385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.38 
 
 		 385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.13 
 
 		 419 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.13 
 
 		 419 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.08 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.17 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  32.44 
 
 		 397 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.84 
 
 		 419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.18 
 
 		 419 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.18 
 
 		 419 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.81 
 
 		 419 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.44 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.71 
 
 		 420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.88 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  27.63 
 
 		 380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.65 
 
 		 430 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.66 
 
 		 446 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.44 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  29.73 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  26.89 
 
 		 640 aa  116  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  27.88 
 
 		 505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  31.72 
 
 		 503 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  28.72 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  28.85 
 
 		 598 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  27.79 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  26.9 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  27.35 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  27.96 
 
 		 315 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  31.13 
 
 		 466 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  28.11 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  27.3 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  28.92 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  28.29 
 
 		 315 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.17 
 
 		 387 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  27.55 
 
 		 387 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  31.46 
 
 		 473 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  31.46 
 
 		 473 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  31.13 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  27.18 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  26.7 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  28.48 
 
 		 383 aa  108  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.97 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  26.97 
 
 		 315 aa  106  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  31.17 
 
 		 491 aa  106  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  30.95 
 
 		 456 aa  106  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  29.13 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  27.49 
 
 		 421 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  25 
 
 		 305 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  29.97 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  29 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  29 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  25.77 
 
 		 305 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  30.13 
 
 		 467 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>