282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2086 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  100 
 
 		 421 aa  864    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  36.47 
 
 		 450 aa  258  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.09 
 
 		 442 aa  146  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.16 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.98 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.62 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.86 
 
 		 443 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.42 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  25.35 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.58 
 
 		 449 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.33 
 
 		 439 aa  126  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.07 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.05 
 
 		 444 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  26.92 
 
 		 415 aa  123  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.5 
 
 		 395 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.16 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  27.45 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.48 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.82 
 
 		 448 aa  106  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.63 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.29 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.29 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.49 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  28.19 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.27 
 
 		 439 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.14 
 
 		 385 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  25.86 
 
 		 431 aa  102  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.62 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  28.62 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.67 
 
 		 449 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  25.8 
 
 		 401 aa  99.8  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.07 
 
 		 446 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  27.15 
 
 		 405 aa  99.8  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  27.61 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.75 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  27.18 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.31 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.55 
 
 		 420 aa  94.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.65 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  27.97 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.42 
 
 		 446 aa  92.8  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.97 
 
 		 419 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  26.26 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  27.91 
 
 		 413 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.68 
 
 		 419 aa  91.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.75 
 
 		 419 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.2 
 
 		 387 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  26.38 
 
 		 396 aa  90.9  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.41 
 
 		 419 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4421  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.23 
 
 		 452 aa  90.1  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.69 
 
 		 419 aa  89.7  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.75 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.69 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.69 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5283  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.32 
 
 		 450 aa  86.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.19 
 
 		 419 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  29.02 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.58 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  25.9 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  23.83 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  25.42 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3884  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.57 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.383079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  27.11 
 
 		 505 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.1 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  23.47 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  28.57 
 
 		 447 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  28.57 
 
 		 447 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  21.34 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2479  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.21 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1842  hypothetical protein  25.55 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  25.87 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  24.83 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.58 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  22.89 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  24.39 
 
 		 524 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  22.55 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  32.89 
 
 		 740 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  24.7 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  27.32 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.26 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  21.54 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  23.67 
 
 		 530 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  23.53 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  25.33 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  24.41 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  29.31 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  22.95 
 
 		 530 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  25 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  29.15 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  28.14 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  23.51 
 
 		 505 aa  57  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  23.08 
 
 		 640 aa  57  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  22.71 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  24.53 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  26.4 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  26.2 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  27.07 
 
 		 416 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.22 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  24.79 
 
 		 455 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.13 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>