More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0655 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  100 
 
 		 397 aa  801    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  52.43 
 
 		 395 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  48.83 
 
 		 415 aa  346  3e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  48.81 
 
 		 385 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  48.81 
 
 		 385 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  48.54 
 
 		 385 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  40.06 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.81 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  39.33 
 
 		 397 aa  246  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.56 
 
 		 445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.52 
 
 		 467 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.24 
 
 		 467 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.29 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.9 
 
 		 442 aa  236  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.73 
 
 		 448 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.6 
 
 		 439 aa  226  4e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.05 
 
 		 442 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.66 
 
 		 446 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  36.14 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.46 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.1 
 
 		 449 aa  209  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.87 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.16 
 
 		 430 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.43 
 
 		 446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.19 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.7 
 
 		 391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.46 
 
 		 419 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.19 
 
 		 419 aa  179  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.65 
 
 		 419 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.43 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.19 
 
 		 419 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.19 
 
 		 419 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.92 
 
 		 419 aa  176  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.92 
 
 		 419 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.38 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.89 
 
 		 419 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.61 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.23 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4421  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.91 
 
 		 452 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  29.85 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  29.68 
 
 		 505 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.98 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5283  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.47 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  28.77 
 
 		 426 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.78 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  28.66 
 
 		 395 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  27.24 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  33.22 
 
 		 410 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  30.4 
 
 		 450 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  28.5 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  30.38 
 
 		 401 aa  137  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  31.45 
 
 		 405 aa  137  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  27.84 
 
 		 414 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  30.06 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.12 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3884  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.67 
 
 		 444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.383079 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2479  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.62 
 
 		 449 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  27.22 
 
 		 446 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  29.75 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  29.75 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  29.75 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.12 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  29.82 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.62 
 
 		 449 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.32 
 
 		 425 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  29.33 
 
 		 405 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  30.74 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  30.43 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  28.8 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  30.39 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  25.85 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  30.38 
 
 		 524 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  25.62 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  26.62 
 
 		 382 aa  94  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  28.57 
 
 		 359 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  28.38 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  25 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  23.66 
 
 		 313 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  26.14 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  23.05 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  24.62 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  27.08 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  23.34 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  27.35 
 
 		 475 aa  83.2  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  24.83 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  22.4 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  23.03 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  22.4 
 
 		 315 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  23.55 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1842  hypothetical protein  24.3 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  22.57 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  22.57 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  27.89 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  26.21 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  27.06 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  26.2 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  26.78 
 
 		 598 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  25.39 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  25.96 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  22.44 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>