More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3232 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  100 
 
 		 382 aa  793    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  41.36 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  37.43 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  34.43 
 
 		 399 aa  192  8e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  33.43 
 
 		 395 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  32.2 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.43 
 
 		 425 aa  156  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  30.61 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  32.5 
 
 		 401 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  31.8 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.8 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.03 
 
 		 405 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  27.34 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  35.05 
 
 		 410 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  30.03 
 
 		 380 aa  143  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  31.18 
 
 		 396 aa  142  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  29.33 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  27.22 
 
 		 414 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  29.58 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.2 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.13 
 
 		 449 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  28.62 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  27.16 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  28.37 
 
 		 505 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  30.04 
 
 		 449 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  31.74 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  29.53 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  31.4 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  31.06 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  29.82 
 
 		 524 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  31.86 
 
 		 315 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  25.26 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  30.51 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  30.72 
 
 		 315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  30.03 
 
 		 315 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  30.03 
 
 		 315 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  27.83 
 
 		 447 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  28.88 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  25.77 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  25.77 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  30.9 
 
 		 314 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  29.15 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  29.15 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  27.68 
 
 		 305 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  27.24 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  28.14 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  29.29 
 
 		 340 aa  106  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  27.93 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  29.06 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  28.28 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  28.28 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  26.58 
 
 		 497 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  26.52 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.59 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  27.55 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  26.99 
 
 		 305 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  27.34 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  27.86 
 
 		 453 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  28.71 
 
 		 491 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  27.48 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  27.4 
 
 		 305 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  26.07 
 
 		 397 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.18 
 
 		 442 aa  99.8  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  27.65 
 
 		 456 aa  99.4  9e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  23.77 
 
 		 598 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  28.19 
 
 		 522 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  28.98 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.74 
 
 		 443 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.33 
 
 		 449 aa  97.1  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  26.95 
 
 		 443 aa  96.7  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  27.5 
 
 		 496 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.24 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  24.7 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  27.3 
 
 		 486 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  28.16 
 
 		 530 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  28.1 
 
 		 305 aa  94  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.62 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  27.63 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.22 
 
 		 467 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  25.45 
 
 		 472 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  26.13 
 
 		 371 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  26.63 
 
 		 475 aa  92.8  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  26.3 
 
 		 305 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  25.86 
 
 		 505 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.22 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.17 
 
 		 444 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.91 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  27.34 
 
 		 309 aa  90.9  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.31 
 
 		 420 aa  90.1  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  26.9 
 
 		 374 aa  90.1  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  25.64 
 
 		 459 aa  89.7  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.99 
 
 		 439 aa  89.7  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  28.72 
 
 		 459 aa  89.7  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  26.51 
 
 		 432 aa  89.7  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  26.27 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  25.7 
 
 		 473 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.23 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  25.8 
 
 		 473 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  25.09 
 
 		 475 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  25.8 
 
 		 473 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>