More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6344 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  836    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  89.61 
 
 		 414 aa  748    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  45.08 
 
 		 390 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  41.16 
 
 		 505 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  42.9 
 
 		 389 aa  255  8e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  39.52 
 
 		 401 aa  243  6e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  39.26 
 
 		 447 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  39.26 
 
 		 447 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  39.26 
 
 		 447 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  39.13 
 
 		 405 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  35.4 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  35.68 
 
 		 405 aa  209  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.85 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  31.95 
 
 		 395 aa  203  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  36.81 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.06 
 
 		 415 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.44 
 
 		 425 aa  180  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.2 
 
 		 419 aa  172  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.06 
 
 		 449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  29.54 
 
 		 412 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.52 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.75 
 
 		 467 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.48 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.28 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  27.76 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.33 
 
 		 443 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.08 
 
 		 385 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.08 
 
 		 385 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.5 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  32.39 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  30.45 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.02 
 
 		 442 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.77 
 
 		 444 aa  137  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  31.23 
 
 		 410 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.46 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  27.16 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.11 
 
 		 442 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.54 
 
 		 419 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  29.49 
 
 		 397 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.83 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.43 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.84 
 
 		 419 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.84 
 
 		 419 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.48 
 
 		 420 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.31 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.93 
 
 		 419 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.86 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.37 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.14 
 
 		 419 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.18 
 
 		 445 aa  123  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.38 
 
 		 408 aa  123  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.69 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  26.78 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  29.79 
 
 		 486 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.23 
 
 		 419 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.95 
 
 		 449 aa  119  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  32.45 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  29.47 
 
 		 530 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.3 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.67 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  34.35 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.07 
 
 		 419 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  31.44 
 
 		 481 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  27.55 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.63 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  29.08 
 
 		 530 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  30.91 
 
 		 417 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  33.62 
 
 		 473 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  28.72 
 
 		 505 aa  113  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  26.62 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  30.8 
 
 		 468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  29.43 
 
 		 640 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  33.19 
 
 		 473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  33.19 
 
 		 473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.74 
 
 		 446 aa  110  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  33.47 
 
 		 467 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  33.05 
 
 		 467 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  31.25 
 
 		 503 aa  106  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  30.36 
 
 		 384 aa  106  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.56 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  29.93 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  23.2 
 
 		 387 aa  103  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  28.32 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  29.67 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  31.23 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  29.94 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  28.75 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.98 
 
 		 468 aa  99.8  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  30.74 
 
 		 475 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  27.61 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  30.67 
 
 		 440 aa  98.6  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  30.42 
 
 		 453 aa  97.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  29.27 
 
 		 371 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  30.22 
 
 		 440 aa  96.7  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  27.24 
 
 		 426 aa  96.7  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  29.41 
 
 		 522 aa  96.3  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  29.43 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  26.99 
 
 		 450 aa  95.9  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  29.87 
 
 		 456 aa  94.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  29.72 
 
 		 459 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>