245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1289 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  100 
 
 		 359 aa  729    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  69.45 
 
 		 368 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  66.29 
 
 		 368 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  62.43 
 
 		 371 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  63.25 
 
 		 371 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  63.03 
 
 		 360 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  65.48 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  63.76 
 
 		 378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  63.48 
 
 		 359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  65.98 
 
 		 362 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  66.18 
 
 		 372 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  47.45 
 
 		 432 aa  290  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  38.96 
 
 		 481 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  38.36 
 
 		 383 aa  176  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  38.36 
 
 		 453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  35.42 
 
 		 468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  38.34 
 
 		 473 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  33.92 
 
 		 491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  38.02 
 
 		 473 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  38.02 
 
 		 473 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  36.74 
 
 		 466 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  33.14 
 
 		 443 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  37.46 
 
 		 467 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  35.95 
 
 		 456 aa  160  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  37.14 
 
 		 467 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  35.03 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  35.16 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  34.84 
 
 		 459 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  35.21 
 
 		 440 aa  152  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  31.35 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  34.86 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  34.63 
 
 		 455 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  30.39 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  32.32 
 
 		 378 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  32.78 
 
 		 522 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  33.1 
 
 		 459 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  32.33 
 
 		 380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  32.33 
 
 		 380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.12 
 
 		 468 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1816  beta-lactamase  32.01 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.403938 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  29.31 
 
 		 468 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  30.65 
 
 		 328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  29.1 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  30.28 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  26.88 
 
 		 401 aa  112  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  26.95 
 
 		 598 aa  112  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  27.08 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.41 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  33.68 
 
 		 496 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  27.38 
 
 		 524 aa  109  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  30.72 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  29.45 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.35 
 
 		 425 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  27.4 
 
 		 397 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3570  beta-lactamase  31.66 
 
 		 479 aa  106  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230187  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  32.29 
 
 		 497 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  24 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  28.12 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.87 
 
 		 449 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.83 
 
 		 415 aa  103  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  31.33 
 
 		 366 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  28.43 
 
 		 640 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.42 
 
 		 419 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  29.67 
 
 		 414 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.42 
 
 		 419 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  29.86 
 
 		 410 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.01 
 
 		 443 aa  99.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.09 
 
 		 419 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  27.43 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  29.7 
 
 		 412 aa  96.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.74 
 
 		 419 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.09 
 
 		 419 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  26.02 
 
 		 530 aa  95.9  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.09 
 
 		 419 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.35 
 
 		 419 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  26.62 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.08 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.57 
 
 		 397 aa  93.6  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  26.64 
 
 		 383 aa  93.6  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  28.71 
 
 		 374 aa  93.6  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  29.73 
 
 		 475 aa  93.2  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.73 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  26.33 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  25.6 
 
 		 400 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.42 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  29.27 
 
 		 486 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  27.62 
 
 		 503 aa  91.3  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  23.24 
 
 		 305 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  25.24 
 
 		 530 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.81 
 
 		 449 aa  90.5  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  28.44 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  26.8 
 
 		 389 aa  89.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  25 
 
 		 413 aa  89.7  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  27.49 
 
 		 414 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.56 
 
 		 445 aa  89.4  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  26.02 
 
 		 505 aa  89.4  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.92 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  23.47 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>