More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6417 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  100 
 
 		 396 aa  801    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  38.78 
 
 		 323 aa  140  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  34.36 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  31.35 
 
 		 466 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  31.7 
 
 		 481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  29.19 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  31.82 
 
 		 473 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  31.82 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  29.7 
 
 		 598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  31.82 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  30.19 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  30.19 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4979  beta-lactamase  27.17 
 
 		 356 aa  126  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  28.62 
 
 		 640 aa  123  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  30.36 
 
 		 467 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  30.36 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  32.57 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  26.75 
 
 		 530 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  28.21 
 
 		 374 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  28.74 
 
 		 524 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  28.93 
 
 		 453 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  29.1 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13543  putative hydrolase transmembrane protein  26.81 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  28.51 
 
 		 505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  29.14 
 
 		 530 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  31.16 
 
 		 378 aa  113  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  27.65 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  25.97 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.11 
 
 		 419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  26.04 
 
 		 522 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  29.52 
 
 		 486 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  24.55 
 
 		 387 aa  109  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  30.52 
 
 		 366 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  28.34 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  26.42 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  28.66 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  25.59 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  24.42 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  28.4 
 
 		 468 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  29.1 
 
 		 360 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  24.5 
 
 		 305 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3104  putative Beta-lactamase  27.7 
 
 		 463 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  29.34 
 
 		 483 aa  106  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  28 
 
 		 384 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  29.08 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1816  beta-lactamase  27.81 
 
 		 494 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.403938 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  24.49 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  23.68 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  27.03 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  25.57 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  30.07 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  25.93 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.24 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  32.02 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  24.34 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  24.17 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.5 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  24.17 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  26.89 
 
 		 505 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  29.18 
 
 		 400 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  29.08 
 
 		 447 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  29.08 
 
 		 447 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.52 
 
 		 468 aa  103  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  24.92 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.54 
 
 		 449 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.45 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.45 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.68 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  24.44 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.45 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.64 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  28.16 
 
 		 384 aa  102  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  27.01 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.91 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.17 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  26.89 
 
 		 503 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  27.42 
 
 		 368 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  30.74 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.97 
 
 		 315 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  29.43 
 
 		 397 aa  99.8  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  27.42 
 
 		 378 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  26.67 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  25.71 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  27.37 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  25.93 
 
 		 462 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  27 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  27.99 
 
 		 496 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  26.64 
 
 		 315 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.78 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  27.42 
 
 		 362 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.23 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  25.71 
 
 		 504 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  29.82 
 
 		 475 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  29.8 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.36 
 
 		 419 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.36 
 
 		 419 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  28.15 
 
 		 472 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.71 
 
 		 452 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  27.84 
 
 		 340 aa  96.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  29.03 
 
 		 383 aa  96.3  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>