220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4979 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4979  beta-lactamase  100 
 
 		 356 aa  734    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13543  putative hydrolase transmembrane protein  47.09 
 
 		 369 aa  301  1e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  27.17 
 
 		 396 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0219  beta-lactamase  27.79 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  25.32 
 
 		 449 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  26.58 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3245  beta-lactamase  26.33 
 
 		 342 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.622434 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.89 
 
 		 340 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  25.9 
 
 		 459 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  26.14 
 
 		 401 aa  87.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  25.84 
 
 		 466 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  25.27 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  25.17 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  25.7 
 
 		 503 aa  82.8  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1124  beta-lactamase  25.18 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  25 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  25.47 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  25.17 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  24.33 
 
 		 473 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  24.33 
 
 		 473 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  24.33 
 
 		 473 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  26.47 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3104  putative Beta-lactamase  24.92 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  23.51 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  24.43 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  22.55 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  24.38 
 
 		 640 aa  77.4  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  23.51 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  26.01 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  25.07 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  25 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  26.4 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  26.07 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  24.32 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0777  beta-lactamase  25.45 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0135628  normal  0.105331 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  26.43 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  25.81 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  25.4 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  22.8 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  24.81 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  23.3 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  23.51 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  23.37 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  26.86 
 
 		 387 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  25.41 
 
 		 405 aa  72.8  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  23.12 
 
 		 522 aa  72.8  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  25.41 
 
 		 378 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4003  hypothetical protein  21.79 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  25.25 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  27.05 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  23 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  25.32 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1816  beta-lactamase  23.28 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.403938 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  24.55 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  26.07 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  26.3 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  26.82 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  26 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.99 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  22.58 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  24.92 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  24.92 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  21.82 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  26.37 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  24.84 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  22.48 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  22.4 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2508  beta-lactamase  22.78 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.650655 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  24.26 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  23.05 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.64 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  24.75 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  23.45 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.19 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.01 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.78 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  22.83 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  21.94 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  23.97 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.08 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.75 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  23.31 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  24.29 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  24.69 
 
 		 530 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  24.29 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  21.75 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  21.75 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  24.39 
 
 		 504 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.77 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  21.82 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.77 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  25.91 
 
 		 468 aa  63.2  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  25.71 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.51 
 
 		 419 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.93 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.77 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.44 
 
 		 449 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  23.58 
 
 		 505 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.77 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.46 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>