224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3245 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3245  beta-lactamase  100 
 
 
342 aa  700    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.622434 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1124  beta-lactamase  46.31 
 
 
346 aa  279  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2508  beta-lactamase  35.16 
 
 
336 aa  180  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.650655 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0777  beta-lactamase  34.27 
 
 
333 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0135628  normal  0.105331 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  28.3 
 
 
371 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  27.56 
 
 
384 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4979  beta-lactamase  27.15 
 
 
356 aa  96.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  27.54 
 
 
466 aa  95.9  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  25.66 
 
 
467 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  29.03 
 
 
372 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  29.62 
 
 
371 aa  93.6  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  25.66 
 
 
467 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  26.89 
 
 
473 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  27.24 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  25.9 
 
 
491 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  24.35 
 
 
481 aa  85.9  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  25.59 
 
 
456 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  25.9 
 
 
473 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  25.9 
 
 
473 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  26.32 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  26.6 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  26.64 
 
 
396 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  25.71 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  26.86 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  26.6 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  26.16 
 
 
459 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  26.05 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  24.33 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  26.85 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  26.74 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  23.1 
 
 
395 aa  75.9  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  25.73 
 
 
475 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  25.82 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  25.76 
 
 
468 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  25.76 
 
 
453 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0219  beta-lactamase  25.13 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13543  putative hydrolase transmembrane protein  23.59 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.61 
 
 
476 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  25.17 
 
 
497 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  24.84 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  25.25 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  24.83 
 
 
496 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  25.09 
 
 
468 aa  66.6  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  23.34 
 
 
432 aa  66.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  25.39 
 
 
378 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2617  beta-lactamase  23.11 
 
 
352 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00306284  normal  0.438823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  24.56 
 
 
455 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  23.71 
 
 
503 aa  65.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  24.52 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  22.64 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0488  beta-lactamase  23.14 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  25.2 
 
 
428 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  23.76 
 
 
472 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  22.27 
 
 
640 aa  62.8  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.83 
 
 
468 aa  62.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  20.47 
 
 
309 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  20.47 
 
 
309 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.13 
 
 
467 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  23 
 
 
475 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  26.64 
 
 
414 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  20.26 
 
 
305 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  20.92 
 
 
305 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  24.89 
 
 
524 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  24.15 
 
 
475 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.13 
 
 
467 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  19.8 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  24.43 
 
 
416 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  21.55 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4003  hypothetical protein  21.77 
 
 
335 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.1 
 
 
419 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  20.85 
 
 
305 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.95 
 
 
480 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  24.09 
 
 
459 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0993  beta-lactamase  24.67 
 
 
312 aa  57.4  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  22.52 
 
 
514 aa  57.4  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.64 
 
 
419 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  20.13 
 
 
305 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  31.88 
 
 
377 aa  56.6  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.64 
 
 
419 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.64 
 
 
419 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.64 
 
 
419 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.64 
 
 
419 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  24.64 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  23.41 
 
 
443 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  24.36 
 
 
387 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  20.72 
 
 
598 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  26.25 
 
 
462 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  22.59 
 
 
530 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  28.05 
 
 
785 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.77 
 
 
419 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  20.92 
 
 
415 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  23.62 
 
 
504 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  20.85 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.43 
 
 
446 aa  54.3  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1876  beta-lactamase  25 
 
 
493 aa  54.3  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  25.33 
 
 
414 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  23.93 
 
 
522 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  27.18 
 
 
507 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  21.55 
 
 
413 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  22.15 
 
 
412 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>