More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2617 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2617  beta-lactamase  100 
 
 		 352 aa  733    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00306284  normal  0.438823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0488  beta-lactamase  35.56 
 
 		 382 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5523  beta-lactamase  31.69 
 
 		 929 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904088  normal  0.44531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  24.74 
 
 		 433 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  24.18 
 
 		 427 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  25.43 
 
 		 447 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  25.71 
 
 		 395 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  26.67 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  27.51 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  28.64 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.72 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  25.24 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  27.76 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  24.04 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  25.59 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5769  beta-lactamase  26.13 
 
 		 670 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  25 
 
 		 539 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  28.84 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  25 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  27.3 
 
 		 430 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  26.29 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  33.52 
 
 		 507 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  29.49 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  29.36 
 
 		 578 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  23.86 
 
 		 582 aa  77  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  24.77 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  33.33 
 
 		 505 aa  76.6  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0394  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  26.19 
 
 		 397 aa  75.9  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  25.15 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  25.85 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2104  beta-lactamase  26.09 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  26.94 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  24.85 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  31.38 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  28.77 
 
 		 574 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  26.87 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  26.2 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  22.01 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  25.15 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  25.13 
 
 		 405 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  24.79 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1072  beta-lactamase  23.06 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  23.85 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  24.53 
 
 		 595 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  24.38 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  22.18 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.79 
 
 		 681 aa  72  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.42 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  24.44 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  26.6 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  21.85 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  24.18 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  23.55 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  24.87 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  26.6 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  25.22 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.2 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  29.38 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  24.27 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2137  beta-lactamase  28.64 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  24.09 
 
 		 601 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1441  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  26.81 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00263583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.15 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  26.21 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  24.73 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  27.35 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  26.41 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  23.91 
 
 		 513 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  28.14 
 
 		 497 aa  70.1  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  27.54 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  24.77 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  23.31 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  26.65 
 
 		 497 aa  69.7  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  29.24 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  30 
 
 		 456 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  23.85 
 
 		 419 aa  69.3  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  29.03 
 
 		 525 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.15 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  30.87 
 
 		 720 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.07 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  27.34 
 
 		 526 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  23.62 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  29.41 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2405  beta-lactamase  30.81 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261903  hitchhiker  0.00562199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  27.72 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.55 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  27.59 
 
 		 407 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  31.33 
 
 		 487 aa  67  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3905  beta-lactamase  23.04 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  25.46 
 
 		 517 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  25.86 
 
 		 790 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  25.74 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  25.72 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.73 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  26.75 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.35 
 
 		 551 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.31 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.73 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  26.75 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  26.75 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>