More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33850 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  100 
 
 		 453 aa  902    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  64.73 
 
 		 451 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  60.84 
 
 		 450 aa  524  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7012  beta-lactamase  54.15 
 
 		 467 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.858592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4863  beta-lactamase  56.12 
 
 		 441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3187  beta-lactamase  51.34 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000216369  hitchhiker  0.000000000911992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  51.97 
 
 		 463 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2708  beta-lactamase  45.88 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1501  beta-lactamase  34.44 
 
 		 447 aa  206  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130484  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01490  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.78 
 
 		 460 aa  199  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.697704 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  28.39 
 
 		 498 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  31.52 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  30.79 
 
 		 470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  27.07 
 
 		 498 aa  118  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  27.07 
 
 		 498 aa  118  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  24.57 
 
 		 446 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.29 
 
 		 378 aa  116  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  28.36 
 
 		 513 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  27.59 
 
 		 524 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  30.09 
 
 		 501 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.85 
 
 		 508 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  28.53 
 
 		 590 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.17 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.18 
 
 		 595 aa  110  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  30.77 
 
 		 401 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  27.86 
 
 		 453 aa  109  8.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  32.42 
 
 		 428 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  25.53 
 
 		 505 aa  109  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.47 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.47 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  27.73 
 
 		 386 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.83 
 
 		 681 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.45 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  25.89 
 
 		 1032 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30360  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.25 
 
 		 550 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  31.13 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  29.47 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.47 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  24.62 
 
 		 446 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.53 
 
 		 407 aa  107  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.14 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  27.76 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.22 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.55 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  28.57 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  29.68 
 
 		 566 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  29.38 
 
 		 593 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  29.79 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  31.03 
 
 		 463 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  28.26 
 
 		 513 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  28.06 
 
 		 475 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  28.7 
 
 		 611 aa  104  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  35.63 
 
 		 370 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  25.64 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  34.09 
 
 		 349 aa  103  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  28.81 
 
 		 385 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  31.27 
 
 		 498 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  29.37 
 
 		 389 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.25 
 
 		 488 aa  103  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.65 
 
 		 388 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  28.8 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  29.38 
 
 		 603 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  25.94 
 
 		 588 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  22.89 
 
 		 543 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  22.89 
 
 		 543 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.6 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.25 
 
 		 601 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  23.65 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  24.85 
 
 		 559 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.71 
 
 		 497 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  33.33 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  29.07 
 
 		 720 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  24.52 
 
 		 353 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  28.62 
 
 		 513 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  28.62 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  31.8 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  28.99 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  32.72 
 
 		 713 aa  99.8  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  28.62 
 
 		 367 aa  99.8  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03210  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.18 
 
 		 521 aa  99.8  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  30.93 
 
 		 347 aa  99.8  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  31.03 
 
 		 467 aa  99.8  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  26.1 
 
 		 497 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  29.62 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  28.62 
 
 		 388 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  28.38 
 
 		 388 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  28.2 
 
 		 388 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  28.38 
 
 		 388 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.2 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  28.66 
 
 		 388 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  28.38 
 
 		 388 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  28.2 
 
 		 388 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.38 
 
 		 388 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.59 
 
 		 377 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  26.73 
 
 		 482 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.86 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.43 
 
 		 420 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  25.07 
 
 		 519 aa  98.2  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  27.19 
 
 		 616 aa  98.2  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>