More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5769 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5769  beta-lactamase  100 
 
 		 670 aa  1372    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  37.02 
 
 		 715 aa  304  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  30.45 
 
 		 681 aa  206  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  28.09 
 
 		 694 aa  204  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  29.02 
 
 		 691 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  29.86 
 
 		 694 aa  192  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  29.29 
 
 		 691 aa  192  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  29.38 
 
 		 691 aa  191  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  27.68 
 
 		 691 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  27.68 
 
 		 691 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  27.68 
 
 		 691 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  27.26 
 
 		 694 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  30.07 
 
 		 834 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  26.52 
 
 		 519 aa  156  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.27 
 
 		 601 aa  143  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.24 
 
 		 595 aa  142  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  26.63 
 
 		 600 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  24.76 
 
 		 588 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  27.93 
 
 		 446 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  25.66 
 
 		 610 aa  107  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  28.75 
 
 		 480 aa  106  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  28.57 
 
 		 461 aa  104  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  31.45 
 
 		 498 aa  103  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  27.3 
 
 		 347 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.88 
 
 		 508 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  24.94 
 
 		 485 aa  101  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  32.81 
 
 		 466 aa  100  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.4 
 
 		 487 aa  99.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  29.18 
 
 		 476 aa  99.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  28.45 
 
 		 428 aa  97.8  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  28.45 
 
 		 452 aa  97.8  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  30.18 
 
 		 559 aa  97.8  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  24.81 
 
 		 485 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  28.04 
 
 		 464 aa  97.4  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  25.06 
 
 		 485 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  25.56 
 
 		 711 aa  97.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  28.49 
 
 		 507 aa  97.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  26.32 
 
 		 966 aa  96.3  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  26.69 
 
 		 437 aa  96.3  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  35.58 
 
 		 478 aa  95.5  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  26.13 
 
 		 378 aa  94  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  27.85 
 
 		 367 aa  93.2  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  30.69 
 
 		 1055 aa  93.6  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  24.18 
 
 		 485 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  26.28 
 
 		 378 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  26.28 
 
 		 378 aa  92  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  30.91 
 
 		 525 aa  92  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  27.81 
 
 		 460 aa  90.9  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  26.36 
 
 		 375 aa  90.9  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  25.95 
 
 		 578 aa  90.9  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  27.46 
 
 		 620 aa  90.5  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  24.62 
 
 		 453 aa  90.5  9e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  26.78 
 
 		 379 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  26.96 
 
 		 456 aa  90.1  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  26.14 
 
 		 530 aa  89.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  29.37 
 
 		 784 aa  89  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  27.76 
 
 		 437 aa  88.6  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  27.36 
 
 		 485 aa  88.6  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  25.68 
 
 		 637 aa  88.6  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  26.99 
 
 		 499 aa  88.6  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  25.48 
 
 		 450 aa  87.4  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.57 
 
 		 505 aa  87.4  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  29.17 
 
 		 362 aa  87.4  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  27.27 
 
 		 440 aa  87  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.76 
 
 		 480 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  23.93 
 
 		 485 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  24.18 
 
 		 485 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  28.08 
 
 		 613 aa  85.9  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  26.32 
 
 		 650 aa  86.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  29.67 
 
 		 543 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  27.78 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.95 
 
 		 342 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  30.73 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  23.68 
 
 		 485 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  26.87 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  28.9 
 
 		 513 aa  85.5  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  28.57 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  24.71 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  24.08 
 
 		 658 aa  84.7  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  25 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  26.71 
 
 		 539 aa  84.3  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  24.71 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  23.86 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  26.82 
 
 		 485 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  24.71 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.65 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  23.93 
 
 		 485 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  25.21 
 
 		 377 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  23.93 
 
 		 485 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  25.56 
 
 		 574 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  25.78 
 
 		 560 aa  83.6  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  26.56 
 
 		 514 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  24.29 
 
 		 340 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  25.38 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  24.69 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  24.29 
 
 		 340 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  26.56 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  25 
 
 		 340 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  25.75 
 
 		 822 aa  83.2  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  24.51 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>