More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0488 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0488  beta-lactamase  100 
 
 		 382 aa  795    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2617  beta-lactamase  35.56 
 
 		 352 aa  170  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00306284  normal  0.438823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5523  beta-lactamase  33.99 
 
 		 929 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904088  normal  0.44531 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  29.63 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.49 
 
 		 484 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  29.49 
 
 		 507 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2104  beta-lactamase  25.19 
 
 		 396 aa  92.8  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  29.47 
 
 		 456 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  25.48 
 
 		 426 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  24.62 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3905  beta-lactamase  25.68 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  27.27 
 
 		 438 aa  87.8  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  25.9 
 
 		 498 aa  87.8  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  25.15 
 
 		 440 aa  87  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  24.36 
 
 		 409 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0394  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  24.21 
 
 		 397 aa  86.7  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  29.57 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1441  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  26.14 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00263583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  22.54 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  22.63 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  24.15 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  24.85 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  25.23 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  29.96 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  24.85 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  26.89 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  27.31 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  28.19 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  28.69 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  26.15 
 
 		 530 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  23.94 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  25.19 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  25.19 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  26.3 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.26 
 
 		 601 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  26.64 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  26.61 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  27.39 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  27.34 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  24.09 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  25.68 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3549  beta-lactamase  26.32 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  23.94 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  28.99 
 
 		 525 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  28.52 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  25.42 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  26.39 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  31.19 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.67 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1551  beta-lactamase  32.31 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0670758  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  27.23 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  24.46 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  26.79 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  26.2 
 
 		 792 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  23.45 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  27.49 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  28.34 
 
 		 478 aa  76.3  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.93 
 
 		 559 aa  76.3  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  33.11 
 
 		 422 aa  76.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3462  beta-lactamase  23.79 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00219099  normal  0.0121501 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  25.63 
 
 		 796 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  26.85 
 
 		 460 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  25.63 
 
 		 796 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  25.37 
 
 		 966 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  27.38 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  22.96 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  25.91 
 
 		 574 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  24.55 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  24.44 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  25.34 
 
 		 785 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  24.37 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  33.95 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2901  beta-lactamase  25.83 
 
 		 760 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453349  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  27.73 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  28.45 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  26.84 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  25.9 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.59 
 
 		 582 aa  74.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  24.24 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  23.85 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  34.87 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  27.27 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  25.83 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  32.7 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  27.21 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  23.92 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  26.22 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  38.35 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0089  beta-lactamase  26.15 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  27.64 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  27.65 
 
 		 505 aa  73.2  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  33.33 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  38.93 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  27.64 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  32.14 
 
 		 611 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  38.35 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  38.35 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  38.35 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  25.96 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  23.56 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>