More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4688 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  64.94 
 
 		 551 aa  648    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  100 
 
 		 462 aa  937    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  36.5 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  35.23 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  34.99 
 
 		 484 aa  232  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  34.79 
 
 		 456 aa  227  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  36.22 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  36.22 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  33.63 
 
 		 464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  34.93 
 
 		 431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  36.96 
 
 		 455 aa  209  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  31.78 
 
 		 539 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  30.69 
 
 		 530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  29.97 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  27.51 
 
 		 691 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  27.27 
 
 		 691 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  30.3 
 
 		 567 aa  124  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  26.62 
 
 		 694 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  26.86 
 
 		 691 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  26.86 
 
 		 691 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  26.47 
 
 		 544 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  25.53 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  26.08 
 
 		 691 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  26.76 
 
 		 588 aa  118  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  25.45 
 
 		 485 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  23.83 
 
 		 485 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  24.62 
 
 		 485 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  25.45 
 
 		 485 aa  117  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  29.68 
 
 		 440 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  29.22 
 
 		 529 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  27.03 
 
 		 691 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  29.89 
 
 		 560 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  24.85 
 
 		 485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  24.85 
 
 		 485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  24.85 
 
 		 485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.12 
 
 		 480 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  25.48 
 
 		 694 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.91 
 
 		 595 aa  113  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  25.42 
 
 		 694 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  24.85 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  27.65 
 
 		 620 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  29.59 
 
 		 513 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  27.55 
 
 		 513 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  24.55 
 
 		 485 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  25.29 
 
 		 485 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  24.31 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.9 
 
 		 601 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  27.7 
 
 		 523 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  30.37 
 
 		 497 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  27.01 
 
 		 603 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  26.61 
 
 		 497 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  28.38 
 
 		 533 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  26.55 
 
 		 519 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  29.01 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  30.75 
 
 		 525 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  24.46 
 
 		 485 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.26 
 
 		 681 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1171  beta-lactamase  23.18 
 
 		 455 aa  100  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  29.83 
 
 		 480 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  22.94 
 
 		 803 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  26.98 
 
 		 476 aa  99  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  24.62 
 
 		 530 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.99 
 
 		 342 aa  96.7  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  24.02 
 
 		 526 aa  96.3  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  28.68 
 
 		 459 aa  96.3  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  26.53 
 
 		 524 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  28.4 
 
 		 793 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  26.71 
 
 		 482 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  26.12 
 
 		 526 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  27.05 
 
 		 530 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  30.82 
 
 		 784 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  27.55 
 
 		 367 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  25.06 
 
 		 519 aa  94  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  23.46 
 
 		 566 aa  93.6  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  26.63 
 
 		 2457 aa  93.6  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  24.58 
 
 		 551 aa  93.2  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  26.4 
 
 		 482 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  24.33 
 
 		 533 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  27.23 
 
 		 544 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  25.61 
 
 		 517 aa  92.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  24.7 
 
 		 513 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  26.97 
 
 		 431 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  25.6 
 
 		 447 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  26.67 
 
 		 483 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  26.19 
 
 		 481 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  26.19 
 
 		 481 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  27.63 
 
 		 430 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  29.68 
 
 		 363 aa  90.9  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  26.67 
 
 		 658 aa  90.9  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  26.19 
 
 		 463 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  26.64 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  29.76 
 
 		 450 aa  90.5  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  24.76 
 
 		 519 aa  90.5  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  26.25 
 
 		 475 aa  90.5  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  25 
 
 		 513 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  24.04 
 
 		 442 aa  90.5  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  25.85 
 
 		 481 aa  90.1  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  25.15 
 
 		 513 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  28.16 
 
 		 490 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  24.46 
 
 		 391 aa  89.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>