More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0683 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  100 
 
 
530 aa  1082    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  35.41 
 
 
455 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  32.99 
 
 
446 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  34.73 
 
 
464 aa  160  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  33.33 
 
 
461 aa  158  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  32.23 
 
 
431 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  30.71 
 
 
437 aa  147  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  31.1 
 
 
456 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.88 
 
 
484 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.4 
 
 
551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  29.92 
 
 
460 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  29.78 
 
 
539 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  30.69 
 
 
462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  31.94 
 
 
480 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  32.53 
 
 
440 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  33.84 
 
 
507 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  29.26 
 
 
463 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  27.49 
 
 
533 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  32.64 
 
 
525 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  38.27 
 
 
480 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  29.02 
 
 
616 aa  107  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  29.93 
 
 
418 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  31.07 
 
 
499 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  30.88 
 
 
420 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.36 
 
 
388 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  30.88 
 
 
420 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.24 
 
 
595 aa  104  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  29.03 
 
 
420 aa  104  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.07 
 
 
508 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  33.17 
 
 
476 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  26.8 
 
 
388 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  28.86 
 
 
481 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  26.78 
 
 
388 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.52 
 
 
477 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  26.78 
 
 
388 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  28.86 
 
 
481 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  28.86 
 
 
481 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.59 
 
 
601 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  28.86 
 
 
463 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  30.88 
 
 
408 aa  101  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  26.06 
 
 
462 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.61 
 
 
487 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.74 
 
 
388 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  27.42 
 
 
443 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  28.71 
 
 
490 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  29.35 
 
 
483 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  28.36 
 
 
481 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  30.22 
 
 
420 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  28.57 
 
 
417 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  34.92 
 
 
459 aa  99.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  26.46 
 
 
388 aa  98.6  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  26.46 
 
 
388 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  28.21 
 
 
370 aa  98.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.46 
 
 
389 aa  98.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  26.46 
 
 
388 aa  98.6  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  26.04 
 
 
650 aa  98.6  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  25.88 
 
 
691 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  27.32 
 
 
533 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  29.14 
 
 
425 aa  97.8  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  27.32 
 
 
533 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  27.32 
 
 
533 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  26.46 
 
 
388 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  25.88 
 
 
691 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  31.08 
 
 
427 aa  97.4  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  24.85 
 
 
429 aa  97.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  30.2 
 
 
483 aa  97.1  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  27.96 
 
 
620 aa  97.1  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.88 
 
 
342 aa  96.7  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.36 
 
 
416 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  31.21 
 
 
401 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.87 
 
 
389 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  29.32 
 
 
401 aa  95.9  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  32.26 
 
 
414 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  26.32 
 
 
637 aa  95.5  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.85 
 
 
442 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  28.27 
 
 
424 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  29.02 
 
 
476 aa  95.1  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.4 
 
 
529 aa  94.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.07 
 
 
544 aa  94.4  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0398  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.75 
 
 
366 aa  94.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.31 
 
 
413 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  27.84 
 
 
422 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  28.29 
 
 
483 aa  94  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  29.84 
 
 
657 aa  94  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.29 
 
 
681 aa  94  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  25.77 
 
 
389 aa  94  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  28.24 
 
 
523 aa  93.6  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  26.54 
 
 
446 aa  93.6  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  27.61 
 
 
424 aa  93.2  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  22.44 
 
 
431 aa  93.2  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  31.65 
 
 
381 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  31.76 
 
 
416 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  28.57 
 
 
420 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  26.81 
 
 
635 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  25.56 
 
 
524 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  27.84 
 
 
503 aa  91.7  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.85 
 
 
389 aa  92  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  27.59 
 
 
519 aa  91.3  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  28.07 
 
 
426 aa  91.3  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  25.41 
 
 
422 aa  90.9  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>