More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3698 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  100 
 
 		 476 aa  934    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  42 
 
 		 480 aa  309  6.999999999999999e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  41.04 
 
 		 480 aa  294  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  40.52 
 
 		 507 aa  253  8.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  45.17 
 
 		 525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.84 
 
 		 508 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  25.26 
 
 		 481 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  25.93 
 
 		 463 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  25.71 
 
 		 481 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  25.71 
 
 		 481 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  25.6 
 
 		 481 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  25.12 
 
 		 483 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.57 
 
 		 497 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  24.9 
 
 		 490 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  28.8 
 
 		 1055 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  25.87 
 
 		 483 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  24.64 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  24.48 
 
 		 505 aa  123  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  24.36 
 
 		 498 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  24.36 
 
 		 498 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  30.69 
 
 		 691 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  22.77 
 
 		 514 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 691 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 691 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 691 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  28.21 
 
 		 369 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  32.38 
 
 		 694 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  32.51 
 
 		 691 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  25.25 
 
 		 1032 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  32.51 
 
 		 691 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.29 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  33.91 
 
 		 694 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  30.38 
 
 		 362 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  26.25 
 
 		 475 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  29.63 
 
 		 529 aa  110  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  32.64 
 
 		 5698 aa  110  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  31.73 
 
 		 694 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.69 
 
 		 477 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.41 
 
 		 392 aa  109  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  29.78 
 
 		 470 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  23.52 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25.78 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  35.91 
 
 		 338 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  30.6 
 
 		 519 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  33.46 
 
 		 547 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  23.29 
 
 		 482 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  31.22 
 
 		 560 aa  107  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  28.57 
 
 		 526 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  29.68 
 
 		 720 aa  106  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  25.71 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  31.23 
 
 		 677 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  34.88 
 
 		 513 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  25.58 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  27.31 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  27.83 
 
 		 519 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  26.15 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  35.78 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  30.77 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  25 
 
 		 578 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  25.68 
 
 		 669 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  33.01 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  28.87 
 
 		 559 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  28.54 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  29.6 
 
 		 601 aa  101  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  25 
 
 		 385 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  31.79 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  26.2 
 
 		 485 aa  99.8  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  26.86 
 
 		 588 aa  99.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  30.51 
 
 		 356 aa  99.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  29.76 
 
 		 966 aa  99  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.99 
 
 		 342 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.87 
 
 		 582 aa  99  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  28.65 
 
 		 510 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5769  beta-lactamase  29.18 
 
 		 670 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  28.99 
 
 		 566 aa  98.2  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  24.66 
 
 		 325 aa  97.8  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  28.18 
 
 		 834 aa  98.2  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  24.91 
 
 		 380 aa  97.8  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  24.42 
 
 		 421 aa  97.4  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  26.38 
 
 		 543 aa  97.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  26.38 
 
 		 543 aa  97.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  28.18 
 
 		 343 aa  97.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  32.63 
 
 		 461 aa  97.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  36.23 
 
 		 471 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  34 
 
 		 423 aa  97.1  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  24.25 
 
 		 446 aa  96.7  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  31.13 
 
 		 553 aa  96.7  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  26.02 
 
 		 399 aa  96.3  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.72 
 
 		 453 aa  95.9  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  29.1 
 
 		 537 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.71 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.16 
 
 		 414 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  24.69 
 
 		 353 aa  96.3  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  23.77 
 
 		 412 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  24.09 
 
 		 421 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  24.09 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  24.05 
 
 		 385 aa  95.9  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  23.69 
 
 		 377 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  23.69 
 
 		 377 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.13 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>