More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0468 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  100 
 
 		 455 aa  913    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  44.44 
 
 		 464 aa  333  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  41.29 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  42.37 
 
 		 484 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  37.84 
 
 		 431 aa  252  8.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  42.58 
 
 		 437 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  40.85 
 
 		 461 aa  232  9e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  39.63 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  37.89 
 
 		 460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  36.76 
 
 		 551 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  36.96 
 
 		 462 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  35.12 
 
 		 539 aa  201  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  35.41 
 
 		 530 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  35.5 
 
 		 440 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  34.11 
 
 		 463 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  27.46 
 
 		 487 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  35.33 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  34.35 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  28.69 
 
 		 578 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  28.28 
 
 		 691 aa  127  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  28.03 
 
 		 691 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1171  beta-lactamase  27.51 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  30.48 
 
 		 530 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  27.83 
 
 		 694 aa  123  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  27.27 
 
 		 691 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.53 
 
 		 595 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  27.27 
 
 		 691 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  31.19 
 
 		 477 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  27.02 
 
 		 691 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  33.56 
 
 		 478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  28.49 
 
 		 513 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  26.96 
 
 		 694 aa  120  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.63 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  31.53 
 
 		 567 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.23 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  25.51 
 
 		 519 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  26.62 
 
 		 691 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.79 
 
 		 601 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.25 
 
 		 480 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.6 
 
 		 413 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  30.07 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.38 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  27.22 
 
 		 694 aa  114  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  28.45 
 
 		 616 aa  114  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.71 
 
 		 388 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  29.45 
 
 		 446 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  27.3 
 
 		 637 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  28.75 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  28.44 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  29.05 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  28.78 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  28.4 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  30.53 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  28.75 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.36 
 
 		 681 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  30.35 
 
 		 560 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  26.8 
 
 		 485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  28.12 
 
 		 635 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  26.62 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  26.88 
 
 		 485 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  27.22 
 
 		 658 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  26.88 
 
 		 485 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  26.17 
 
 		 544 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  26.88 
 
 		 485 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.66 
 
 		 416 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  30.55 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  26.88 
 
 		 485 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.69 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  28.57 
 
 		 533 aa  110  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  27.89 
 
 		 513 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  28.57 
 
 		 388 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  29 
 
 		 388 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  27.88 
 
 		 490 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  26.01 
 
 		 485 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  28.81 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.81 
 
 		 389 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  28.81 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  28.81 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  28.27 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  27.66 
 
 		 481 aa  108  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  27.63 
 
 		 483 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  23.47 
 
 		 485 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  28.37 
 
 		 388 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  24.15 
 
 		 669 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  27.88 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.33 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  24.62 
 
 		 588 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  31.1 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  28.09 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  27.6 
 
 		 2457 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  28.14 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  25.72 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.19 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  26.74 
 
 		 483 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  28.52 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  24.2 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  32.51 
 
 		 462 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  25.07 
 
 		 543 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  29.94 
 
 		 480 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>