More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1839 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  100 
 
 		 681 aa  1409    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  33.85 
 
 		 834 aa  363  6e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  29.7 
 
 		 691 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  29.84 
 
 		 691 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  29.84 
 
 		 691 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  31.1 
 
 		 694 aa  267  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  30.27 
 
 		 691 aa  263  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  29.72 
 
 		 691 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  30 
 
 		 691 aa  261  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  29.76 
 
 		 694 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  30.31 
 
 		 694 aa  258  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  30.23 
 
 		 715 aa  239  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  31.61 
 
 		 519 aa  237  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5769  beta-lactamase  30.45 
 
 		 670 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  30.97 
 
 		 487 aa  143  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  30.47 
 
 		 437 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  32.72 
 
 		 461 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28 
 
 		 595 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.31 
 
 		 559 aa  131  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.35 
 
 		 601 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  27.01 
 
 		 610 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  30.95 
 
 		 480 aa  124  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  30.89 
 
 		 446 aa  123  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  27.32 
 
 		 356 aa  123  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  30.4 
 
 		 567 aa  123  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.97 
 
 		 539 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  26.85 
 
 		 600 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  25.67 
 
 		 588 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.64 
 
 		 416 aa  121  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  25.37 
 
 		 399 aa  119  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  28.09 
 
 		 431 aa  119  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  30.22 
 
 		 677 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  28.45 
 
 		 519 aa  118  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  29.32 
 
 		 530 aa  118  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  28.35 
 
 		 464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.95 
 
 		 442 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  28.45 
 
 		 526 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.78 
 
 		 390 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.25 
 
 		 508 aa  114  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  26.91 
 
 		 363 aa  114  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  25.12 
 
 		 543 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  29.93 
 
 		 391 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  28.53 
 
 		 650 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  25.12 
 
 		 543 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  26.61 
 
 		 537 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.24 
 
 		 383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  27.2 
 
 		 451 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  25.71 
 
 		 466 aa  111  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  26.67 
 
 		 658 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  27.22 
 
 		 478 aa  110  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.17 
 
 		 477 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  30.25 
 
 		 374 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  27.27 
 
 		 529 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  28.65 
 
 		 395 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  25.71 
 
 		 400 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  26.67 
 
 		 593 aa  109  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.63 
 
 		 342 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  26.76 
 
 		 582 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  26.98 
 
 		 533 aa  108  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.55 
 
 		 480 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  27.02 
 
 		 377 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  26.83 
 
 		 453 aa  107  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.23 
 
 		 392 aa  107  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.12 
 
 		 551 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  31.28 
 
 		 470 aa  107  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  24.73 
 
 		 353 aa  107  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.8 
 
 		 362 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.26 
 
 		 414 aa  107  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26.39 
 
 		 421 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  25.29 
 
 		 486 aa  107  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  23.92 
 
 		 446 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  27.52 
 
 		 445 aa  107  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  28.53 
 
 		 431 aa  106  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  26.09 
 
 		 611 aa  106  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  26.78 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  25.62 
 
 		 578 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  26.86 
 
 		 378 aa  105  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  31.38 
 
 		 371 aa  104  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  27.23 
 
 		 442 aa  105  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  26.02 
 
 		 421 aa  104  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  26.02 
 
 		 412 aa  104  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.66 
 
 		 399 aa  104  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  29.11 
 
 		 422 aa  104  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  26.02 
 
 		 412 aa  104  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  25.37 
 
 		 669 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  26.02 
 
 		 415 aa  104  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  27.48 
 
 		 803 aa  104  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  32.39 
 
 		 403 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  26.83 
 
 		 431 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  28.34 
 
 		 657 aa  103  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.65 
 
 		 422 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  26.3 
 
 		 416 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  25.77 
 
 		 635 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  26.71 
 
 		 395 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  25 
 
 		 447 aa  103  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  24.67 
 
 		 497 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  25.97 
 
 		 848 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  25.47 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  25.65 
 
 		 413 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  26.17 
 
 		 603 aa  102  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>