More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3274 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  100 
 
 		 524 aa  1075    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  60.29 
 
 		 501 aa  617  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03210  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.9 
 
 		 521 aa  180  4.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  28.35 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  30.26 
 
 		 595 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  31.21 
 
 		 505 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  30.4 
 
 		 362 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  29.83 
 
 		 498 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  30.7 
 
 		 485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  28.65 
 
 		 498 aa  134  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  28.65 
 
 		 498 aa  134  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  29.08 
 
 		 401 aa  134  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  28.23 
 
 		 486 aa  133  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  28.46 
 
 		 463 aa  126  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  27.97 
 
 		 614 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  29.06 
 
 		 601 aa  124  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.7 
 
 		 487 aa  124  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  31.27 
 
 		 526 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  29.15 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  28.57 
 
 		 485 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  33.04 
 
 		 488 aa  120  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  28.28 
 
 		 485 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  27.86 
 
 		 463 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  27.89 
 
 		 485 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  26.68 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  28.57 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  27.91 
 
 		 485 aa  115  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  27.6 
 
 		 588 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  27.06 
 
 		 513 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  28.44 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.25 
 
 		 497 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0860  beta-lactamase  27.25 
 
 		 457 aa  115  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164383  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  26.84 
 
 		 351 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  27.7 
 
 		 485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  26.82 
 
 		 520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.59 
 
 		 453 aa  114  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  28.75 
 
 		 391 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  28.87 
 
 		 544 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  27.98 
 
 		 377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  27.7 
 
 		 485 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  31.56 
 
 		 356 aa  111  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  27.7 
 
 		 485 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  29.66 
 
 		 477 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  28.14 
 
 		 450 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3187  beta-lactamase  26.8 
 
 		 454 aa  110  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000216369  hitchhiker  0.000000000911992 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  27.41 
 
 		 485 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  25.7 
 
 		 669 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  26.84 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  32.09 
 
 		 440 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  27.15 
 
 		 578 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  25.95 
 
 		 519 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  26.22 
 
 		 711 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  27.66 
 
 		 475 aa  107  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  28.07 
 
 		 478 aa  107  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  29.02 
 
 		 533 aa  107  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  28.99 
 
 		 422 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  27.99 
 
 		 662 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  25.06 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  28.67 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  26.42 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  27.14 
 
 		 353 aa  105  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  27.36 
 
 		 419 aa  105  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4863  beta-lactamase  28.33 
 
 		 441 aa  104  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  24.78 
 
 		 482 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  26.61 
 
 		 530 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.03 
 
 		 559 aa  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  28.2 
 
 		 513 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  24.78 
 
 		 482 aa  103  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  28.11 
 
 		 375 aa  103  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  34.18 
 
 		 426 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3756  beta-lactamase  28.49 
 
 		 378 aa  103  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  26.58 
 
 		 600 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  25.2 
 
 		 1032 aa  103  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  29.32 
 
 		 513 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.41 
 
 		 493 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  29.7 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  30.52 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  31.92 
 
 		 528 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  31.92 
 
 		 528 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25 
 
 		 514 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  30.04 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  24.93 
 
 		 342 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  27.56 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  27.87 
 
 		 513 aa  101  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  25.9 
 
 		 822 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  25.48 
 
 		 451 aa  101  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  26.15 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  25.67 
 
 		 466 aa  100  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  26.97 
 
 		 537 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  23.28 
 
 		 475 aa  100  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  29.87 
 
 		 427 aa  99.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  30.09 
 
 		 375 aa  99.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  26.65 
 
 		 529 aa  99.8  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  26.99 
 
 		 427 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  29.23 
 
 		 681 aa  99.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  27.27 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  27.6 
 
 		 375 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  28.2 
 
 		 513 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  27.1 
 
 		 325 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  32.77 
 
 		 462 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>