More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4610 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  74.86 
 
 		 531 aa  797    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  100 
 
 		 533 aa  1078    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  59.84 
 
 		 533 aa  597  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  53.92 
 
 		 536 aa  522  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  51.21 
 
 		 562 aa  523  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  53.89 
 
 		 533 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  53.89 
 
 		 533 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  53.89 
 
 		 533 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  51.08 
 
 		 531 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  50.88 
 
 		 531 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  48.11 
 
 		 551 aa  486  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  52.07 
 
 		 485 aa  478  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  44.91 
 
 		 530 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  45.7 
 
 		 519 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  46.89 
 
 		 566 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  41.18 
 
 		 544 aa  359  8e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  40.53 
 
 		 519 aa  350  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  40.34 
 
 		 519 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  41.19 
 
 		 550 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  39.67 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  36.36 
 
 		 503 aa  259  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  31.86 
 
 		 803 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  31 
 
 		 544 aa  206  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  31.54 
 
 		 519 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  29.96 
 
 		 523 aa  203  8e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  30.91 
 
 		 513 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  31.26 
 
 		 529 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  29.65 
 
 		 526 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  28.46 
 
 		 499 aa  187  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  27.13 
 
 		 517 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  27.49 
 
 		 497 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  29.24 
 
 		 567 aa  171  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  27.52 
 
 		 526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  34.11 
 
 		 447 aa  161  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  32.07 
 
 		 466 aa  160  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  27.85 
 
 		 520 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  30.38 
 
 		 547 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  26.29 
 
 		 485 aa  154  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  26.19 
 
 		 485 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  26.11 
 
 		 591 aa  153  8.999999999999999e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  26.67 
 
 		 485 aa  153  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  26.67 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  26.67 
 
 		 485 aa  153  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  26.36 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  26.44 
 
 		 485 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  26.16 
 
 		 485 aa  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  25.72 
 
 		 485 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  30.36 
 
 		 455 aa  147  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  28.22 
 
 		 566 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  30.36 
 
 		 455 aa  147  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  25.23 
 
 		 485 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  29.61 
 
 		 517 aa  143  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  25.42 
 
 		 485 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  32.13 
 
 		 655 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  27.48 
 
 		 603 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  29.31 
 
 		 620 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  29.41 
 
 		 380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27 
 
 		 551 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  27.65 
 
 		 389 aa  121  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  26.57 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  26.25 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  25.34 
 
 		 426 aa  115  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.34 
 
 		 539 aa  114  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  29.1 
 
 		 445 aa  110  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  27.95 
 
 		 464 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  26.65 
 
 		 717 aa  110  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  29.36 
 
 		 530 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  28.78 
 
 		 461 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.23 
 
 		 601 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  27.56 
 
 		 533 aa  108  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  30.93 
 
 		 497 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.14 
 
 		 498 aa  107  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  25.74 
 
 		 822 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  27.17 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.32 
 
 		 595 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  29.62 
 
 		 444 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  27.7 
 
 		 391 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  31.3 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  29.25 
 
 		 525 aa  101  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  23 
 
 		 486 aa  101  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.44 
 
 		 480 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  26.9 
 
 		 399 aa  100  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  27.71 
 
 		 384 aa  100  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  25.26 
 
 		 426 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  27.81 
 
 		 364 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  25.51 
 
 		 481 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  26.06 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  26.33 
 
 		 431 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  26.37 
 
 		 658 aa  98.6  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  25.43 
 
 		 463 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  25.43 
 
 		 481 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  28.01 
 
 		 440 aa  97.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  24.56 
 
 		 481 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  24.56 
 
 		 481 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  22.25 
 
 		 669 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  25.27 
 
 		 501 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  22.85 
 
 		 490 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  26.65 
 
 		 381 aa  95.9  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  26.1 
 
 		 778 aa  94.4  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  26.39 
 
 		 365 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>