More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1621 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  100 
 
 		 426 aa  878    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  45.21 
 
 		 385 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  44.47 
 
 		 389 aa  351  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  45.59 
 
 		 380 aa  351  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  42.37 
 
 		 385 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  41.36 
 
 		 399 aa  333  3e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03893  putative beta-lactamase  38.24 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  35.17 
 
 		 377 aa  260  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  36.31 
 
 		 447 aa  256  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  38.41 
 
 		 455 aa  256  8e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  38.1 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3874  beta-lactamase  35.19 
 
 		 359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  37.66 
 
 		 466 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  32.69 
 
 		 445 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  29.94 
 
 		 444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  28.99 
 
 		 526 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  27 
 
 		 513 aa  146  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0370  beta-lactamase  29.67 
 
 		 403 aa  145  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.405453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  30.68 
 
 		 517 aa  142  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  28.15 
 
 		 520 aa  141  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.71 
 
 		 544 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  25.8 
 
 		 803 aa  136  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  27.9 
 
 		 566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  24.78 
 
 		 567 aa  132  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  25.23 
 
 		 519 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  27.68 
 
 		 566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  25.53 
 
 		 519 aa  127  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  24.04 
 
 		 523 aa  126  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  27.79 
 
 		 526 aa  126  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  24.23 
 
 		 485 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  24.62 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  28.06 
 
 		 530 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  25.15 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  24.45 
 
 		 497 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  27.73 
 
 		 533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  23.62 
 
 		 485 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  25.15 
 
 		 485 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  31.28 
 
 		 485 aa  116  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  27.08 
 
 		 544 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  27.41 
 
 		 559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  24.62 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  24.93 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  26.73 
 
 		 519 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  24.23 
 
 		 485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  24.23 
 
 		 485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  23.93 
 
 		 485 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  23.93 
 
 		 485 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  24.23 
 
 		 485 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  23.8 
 
 		 499 aa  113  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  25.29 
 
 		 547 aa  113  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  24.93 
 
 		 503 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  24.93 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  24.53 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  25.98 
 
 		 1032 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  24.08 
 
 		 591 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  27.01 
 
 		 533 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  25.45 
 
 		 531 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  27.01 
 
 		 533 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  27.01 
 
 		 533 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  28.12 
 
 		 550 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  26.96 
 
 		 822 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  23.27 
 
 		 529 aa  110  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  22.4 
 
 		 505 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  26.37 
 
 		 536 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  24.01 
 
 		 531 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  26.92 
 
 		 455 aa  106  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  27.3 
 
 		 562 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  23.16 
 
 		 519 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  28.66 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  21.66 
 
 		 517 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  22.25 
 
 		 603 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  23.64 
 
 		 620 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  25.43 
 
 		 483 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.13 
 
 		 514 aa  104  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  24.93 
 
 		 551 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  24.48 
 
 		 498 aa  103  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  24.48 
 
 		 498 aa  103  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  27.73 
 
 		 481 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  25.88 
 
 		 362 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  25.34 
 
 		 533 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  27.14 
 
 		 463 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.21 
 
 		 477 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  26.9 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  26.9 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  22.7 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  29.38 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  25.5 
 
 		 386 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  26.3 
 
 		 481 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  24 
 
 		 580 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  24.73 
 
 		 367 aa  97.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  25.61 
 
 		 483 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  21.53 
 
 		 451 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0563  beta-lactamase  23.53 
 
 		 506 aa  95.5  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000636485 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  25.85 
 
 		 490 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  25.77 
 
 		 578 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  20.88 
 
 		 655 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  22.82 
 
 		 403 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  23.24 
 
 		 446 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  24.01 
 
 		 543 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  24.01 
 
 		 543 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>