More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4990 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  69.71 
 
 		 533 aa  697    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  69.71 
 
 		 533 aa  697    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  100 
 
 		 531 aa  1075    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  69.71 
 
 		 533 aa  697    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  87.01 
 
 		 531 aa  941    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  58.46 
 
 		 562 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  54.82 
 
 		 551 aa  548  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  52.52 
 
 		 533 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  53.8 
 
 		 485 aa  491  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  49.63 
 
 		 531 aa  484  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  51.08 
 
 		 533 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  51.56 
 
 		 536 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  49.69 
 
 		 519 aa  415  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  45.4 
 
 		 530 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  48.87 
 
 		 566 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  42.21 
 
 		 544 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  45.68 
 
 		 550 aa  347  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  41.7 
 
 		 519 aa  320  5e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  41.08 
 
 		 519 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  36.02 
 
 		 455 aa  248  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  35.23 
 
 		 503 aa  243  6e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  30.72 
 
 		 513 aa  198  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  30.09 
 
 		 803 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  29.36 
 
 		 544 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  29.7 
 
 		 523 aa  177  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  29.37 
 
 		 485 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  28.64 
 
 		 485 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  29.94 
 
 		 519 aa  170  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  28.44 
 
 		 485 aa  169  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  28.9 
 
 		 485 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  28.9 
 
 		 485 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  27.72 
 
 		 526 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  28.9 
 
 		 485 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  27.57 
 
 		 485 aa  167  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  31.46 
 
 		 567 aa  166  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  27.97 
 
 		 485 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  28.67 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  27.61 
 
 		 485 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  26.87 
 
 		 485 aa  160  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  25.93 
 
 		 591 aa  150  8e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.17 
 
 		 529 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  29.77 
 
 		 499 aa  148  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  26.56 
 
 		 526 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  28.57 
 
 		 655 aa  143  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  31.86 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  27.1 
 
 		 566 aa  137  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  29.43 
 
 		 455 aa  137  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  30.23 
 
 		 455 aa  137  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  30.79 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  29.22 
 
 		 547 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  24.78 
 
 		 517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  25.06 
 
 		 520 aa  133  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  27.08 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  25.99 
 
 		 497 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  26.2 
 
 		 603 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  24.48 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  28.01 
 
 		 517 aa  118  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  30.09 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  24.93 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  27.82 
 
 		 822 aa  113  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  28.5 
 
 		 717 aa  111  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  27.56 
 
 		 620 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  22.31 
 
 		 385 aa  110  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.12 
 
 		 601 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  30.12 
 
 		 539 aa  109  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  29.03 
 
 		 444 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  22.28 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.98 
 
 		 595 aa  103  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  28.7 
 
 		 498 aa  103  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  25.36 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  22.68 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  26.99 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  26.87 
 
 		 426 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  22.96 
 
 		 481 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  22.96 
 
 		 481 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  22.96 
 
 		 463 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  22.96 
 
 		 481 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.37 
 
 		 392 aa  97.8  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  27.33 
 
 		 431 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.61 
 
 		 514 aa  97.4  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  22.5 
 
 		 490 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  29.66 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  23.74 
 
 		 353 aa  94.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  23.12 
 
 		 483 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  22.64 
 
 		 483 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  28.2 
 
 		 616 aa  92.8  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.67 
 
 		 551 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  29.84 
 
 		 377 aa  92.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  27.61 
 
 		 1055 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  27.02 
 
 		 401 aa  91.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.61 
 
 		 367 aa  90.9  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  26.67 
 
 		 600 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03893  putative beta-lactamase  27.4 
 
 		 363 aa  89.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  28.49 
 
 		 476 aa  89.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  22.88 
 
 		 486 aa  89.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  26.4 
 
 		 466 aa  89  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  23.29 
 
 		 669 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  25.79 
 
 		 356 aa  87.8  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25.61 
 
 		 487 aa  87.8  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2174  beta-lactamase  26.29 
 
 		 429 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>