More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3500 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  100 
 
 		 600 aa  1214    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  70.6 
 
 		 610 aa  846    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  33.62 
 
 		 601 aa  332  8e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  34.54 
 
 		 595 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  33.05 
 
 		 588 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  31.79 
 
 		 715 aa  157  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  29.79 
 
 		 498 aa  128  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  25 
 
 		 505 aa  126  9e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  29.48 
 
 		 669 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  28.04 
 
 		 650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.85 
 
 		 681 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.5 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  28.99 
 
 		 530 aa  121  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  27.59 
 
 		 398 aa  120  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5769  beta-lactamase  26.63 
 
 		 670 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  26.33 
 
 		 691 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  26.33 
 
 		 691 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  28.32 
 
 		 822 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.92 
 
 		 539 aa  118  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  26.08 
 
 		 691 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  25.52 
 
 		 498 aa  118  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  23.23 
 
 		 485 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  25.52 
 
 		 498 aa  118  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  23.23 
 
 		 485 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  23.23 
 
 		 485 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  26.84 
 
 		 691 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  26.9 
 
 		 691 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  22.42 
 
 		 485 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  28.12 
 
 		 401 aa  117  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  33.02 
 
 		 356 aa  116  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  22.81 
 
 		 485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  22.78 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  23.5 
 
 		 1032 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  23.23 
 
 		 485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  25.29 
 
 		 658 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  28.15 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  22.59 
 
 		 485 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.05 
 
 		 483 aa  113  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  24.32 
 
 		 1055 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  22.15 
 
 		 485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  27.93 
 
 		 616 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  27.62 
 
 		 662 aa  112  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  24.16 
 
 		 365 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.9 
 
 		 484 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  24.59 
 
 		 485 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  25.42 
 
 		 513 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  25.2 
 
 		 533 aa  110  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  25.95 
 
 		 580 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  24.45 
 
 		 691 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  23.64 
 
 		 485 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  29.17 
 
 		 614 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  24.59 
 
 		 694 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  27.08 
 
 		 513 aa  109  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.83 
 
 		 342 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  30.79 
 
 		 513 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  29.73 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4139  beta-lactamase  27.61 
 
 		 422 aa  107  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  26.38 
 
 		 513 aa  107  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.73 
 
 		 487 aa  107  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  26.67 
 
 		 635 aa  107  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  28.69 
 
 		 410 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  25.72 
 
 		 461 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  29.38 
 
 		 478 aa  106  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  26.26 
 
 		 633 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  26.23 
 
 		 513 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.51 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  26.6 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  25.94 
 
 		 637 aa  105  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  27.42 
 
 		 446 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  27.35 
 
 		 450 aa  105  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  24.79 
 
 		 395 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.06 
 
 		 477 aa  104  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  29.08 
 
 		 567 aa  103  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  23.4 
 
 		 694 aa  103  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  23.67 
 
 		 514 aa  103  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  26.14 
 
 		 481 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  26.14 
 
 		 481 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  26.46 
 
 		 486 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  26.58 
 
 		 524 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  27.89 
 
 		 410 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  27.47 
 
 		 507 aa  103  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  27.78 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  23.28 
 
 		 578 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  27.89 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  26.71 
 
 		 464 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  26.45 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  26.14 
 
 		 463 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  26.77 
 
 		 694 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  25.76 
 
 		 481 aa  101  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  27.11 
 
 		 657 aa  101  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  27.14 
 
 		 497 aa  101  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  28.61 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  27.3 
 
 		 437 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  24.91 
 
 		 483 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  28.01 
 
 		 405 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  24.02 
 
 		 455 aa  99.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  23.97 
 
 		 717 aa  99.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  32.24 
 
 		 674 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  31.03 
 
 		 593 aa  99  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3157  beta-lactamase  23.08 
 
 		 345 aa  99.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00126272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>