More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1625 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  100 
 
 		 533 aa  1080    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  58.59 
 
 		 533 aa  587  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  58.44 
 
 		 531 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  57.88 
 
 		 562 aa  552  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  50.28 
 
 		 551 aa  514  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  52.52 
 
 		 531 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  49.91 
 
 		 531 aa  511  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  54.26 
 
 		 533 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  54.26 
 
 		 533 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  54.26 
 
 		 533 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  52.72 
 
 		 536 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  55.01 
 
 		 485 aa  481  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  47.34 
 
 		 519 aa  423  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  48.19 
 
 		 566 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  42.86 
 
 		 544 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  43.77 
 
 		 530 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  42.34 
 
 		 519 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  41.94 
 
 		 519 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  44.06 
 
 		 550 aa  346  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  37.11 
 
 		 503 aa  268  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  37.32 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  30.57 
 
 		 523 aa  203  6e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  33.63 
 
 		 529 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  31.44 
 
 		 803 aa  199  9e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  31.65 
 
 		 513 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  30.85 
 
 		 544 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  33.41 
 
 		 519 aa  189  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  29.76 
 
 		 526 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  28.68 
 
 		 499 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  27.88 
 
 		 526 aa  169  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  30.1 
 
 		 567 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  28.34 
 
 		 520 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  27.04 
 
 		 485 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  32.09 
 
 		 466 aa  158  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  28.16 
 
 		 497 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  27.05 
 
 		 485 aa  156  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  27.44 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  27.05 
 
 		 485 aa  156  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  26.88 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  26.82 
 
 		 485 aa  154  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  32.35 
 
 		 447 aa  154  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  27.49 
 
 		 485 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  26.21 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  25.61 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  31.04 
 
 		 547 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  25.83 
 
 		 485 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  26.43 
 
 		 517 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  26.67 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  26.37 
 
 		 591 aa  147  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  28.47 
 
 		 566 aa  144  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  29.17 
 
 		 455 aa  140  7e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  29.17 
 
 		 455 aa  140  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  32.92 
 
 		 517 aa  139  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  30.88 
 
 		 539 aa  128  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  27.47 
 
 		 603 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  27.73 
 
 		 426 aa  128  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  28.78 
 
 		 380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  28.27 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  28.64 
 
 		 620 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  28.02 
 
 		 717 aa  120  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  26.53 
 
 		 655 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  26.38 
 
 		 385 aa  118  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  29.79 
 
 		 377 aa  118  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  25.07 
 
 		 385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  24.01 
 
 		 389 aa  114  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  29.1 
 
 		 595 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.81 
 
 		 498 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  28.65 
 
 		 444 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  31.03 
 
 		 356 aa  110  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.21 
 
 		 601 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  25.77 
 
 		 533 aa  104  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  29.3 
 
 		 440 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  27.83 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  24.93 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.55 
 
 		 342 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  25.52 
 
 		 600 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  28.21 
 
 		 822 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  27.22 
 
 		 384 aa  97.1  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  28.21 
 
 		 431 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  24.53 
 
 		 524 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  27.15 
 
 		 430 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3874  beta-lactamase  27.33 
 
 		 359 aa  95.9  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03893  putative beta-lactamase  26.63 
 
 		 363 aa  94.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  28.7 
 
 		 401 aa  94.4  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.88 
 
 		 834 aa  94.4  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  24.09 
 
 		 481 aa  93.6  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  23.33 
 
 		 490 aa  94  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2174  beta-lactamase  25.13 
 
 		 429 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2236  beta-lactamase  25.58 
 
 		 428 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  26.96 
 
 		 460 aa  92.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  26.76 
 
 		 466 aa  92  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  24.04 
 
 		 483 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  25.57 
 
 		 453 aa  90.5  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  22.11 
 
 		 486 aa  90.5  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  28.19 
 
 		 405 aa  90.5  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  25.87 
 
 		 463 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  25.32 
 
 		 481 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  26.18 
 
 		 481 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  26.18 
 
 		 481 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25.24 
 
 		 487 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>