More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1351 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  100 
 
 		 384 aa  782    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  28.65 
 
 		 401 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  27.82 
 
 		 578 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.77 
 
 		 487 aa  119  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  29.77 
 
 		 345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  29.88 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  24.66 
 
 		 530 aa  106  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  25.61 
 
 		 519 aa  104  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  28.36 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  30.04 
 
 		 449 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  31.58 
 
 		 477 aa  102  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  26.76 
 
 		 485 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  27.07 
 
 		 531 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  23.29 
 
 		 595 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  25.53 
 
 		 446 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  26.21 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.21 
 
 		 544 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  24.86 
 
 		 513 aa  96.7  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  25.71 
 
 		 483 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  25.92 
 
 		 485 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  24.32 
 
 		 504 aa  94.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  25.15 
 
 		 567 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  25.92 
 
 		 485 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  26.15 
 
 		 533 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  33.14 
 
 		 611 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  27.22 
 
 		 533 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  26.01 
 
 		 501 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  25.22 
 
 		 713 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  27.27 
 
 		 369 aa  94  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  25.74 
 
 		 380 aa  93.6  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  27.52 
 
 		 498 aa  93.6  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  25 
 
 		 445 aa  93.2  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  25.71 
 
 		 490 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  25.64 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  25.64 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  26.63 
 
 		 446 aa  92.8  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  25.22 
 
 		 551 aa  92.8  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  23.86 
 
 		 453 aa  92.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  25.16 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  26.11 
 
 		 485 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  25.63 
 
 		 485 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  25.46 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  30.39 
 
 		 593 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  24.01 
 
 		 1032 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  33.14 
 
 		 603 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  24.61 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  23.89 
 
 		 505 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  23.04 
 
 		 529 aa  90.9  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  26.45 
 
 		 364 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  23.28 
 
 		 803 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  25.35 
 
 		 485 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  35.54 
 
 		 496 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  25.29 
 
 		 566 aa  90.1  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  28.64 
 
 		 614 aa  90.1  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  26.05 
 
 		 485 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  25.52 
 
 		 447 aa  89.7  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1798  putative penicillin-binding protein  26.2 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  25.21 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  24.68 
 
 		 481 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  28.69 
 
 		 409 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  24.06 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  26.05 
 
 		 485 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  25.77 
 
 		 485 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  32.07 
 
 		 464 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  26.05 
 
 		 485 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  25.54 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  27.71 
 
 		 342 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  30.14 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  27.74 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  25.5 
 
 		 519 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  23.22 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  25.45 
 
 		 481 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  25.2 
 
 		 397 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  24.35 
 
 		 681 aa  87  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.22 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  24.49 
 
 		 485 aa  87  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  24.32 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  26.86 
 
 		 591 aa  86.7  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  25.32 
 
 		 524 aa  86.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  25.93 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.16 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  25.93 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  25.62 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  30.96 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  25.45 
 
 		 633 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  29.28 
 
 		 543 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  29.28 
 
 		 543 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  23.99 
 
 		 650 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  24.46 
 
 		 616 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  27.61 
 
 		 543 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  25.79 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  25.23 
 
 		 531 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  27.82 
 
 		 848 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  24.01 
 
 		 1055 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  26.29 
 
 		 519 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.69 
 
 		 559 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  25.82 
 
 		 533 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  25.82 
 
 		 533 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  26.33 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  32.53 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>