More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6561 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  85.86 
 
 		 389 aa  648    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  97.94 
 
 		 389 aa  743    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  100 
 
 		 389 aa  790    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  83.12 
 
 		 389 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  97.94 
 
 		 389 aa  743    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  81.3 
 
 		 389 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  76.09 
 
 		 389 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  61.04 
 
 		 391 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  58.79 
 
 		 388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  49.87 
 
 		 385 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  54.21 
 
 		 384 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  51.65 
 
 		 405 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  49.87 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  49.22 
 
 		 401 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  49.6 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  50.79 
 
 		 390 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  49.87 
 
 		 394 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  53.35 
 
 		 386 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  52.46 
 
 		 378 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  50.96 
 
 		 385 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  48.11 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  47.72 
 
 		 394 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  49.07 
 
 		 394 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  47.41 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  47.28 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  50.41 
 
 		 383 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  48.64 
 
 		 388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  50.14 
 
 		 405 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  48.38 
 
 		 387 aa  343  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  47.23 
 
 		 387 aa  343  4e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  41.45 
 
 		 383 aa  339  5e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  48.4 
 
 		 387 aa  335  5.999999999999999e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  46.03 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  46.44 
 
 		 397 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  40.95 
 
 		 396 aa  319  5e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  45.66 
 
 		 378 aa  316  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  43.9 
 
 		 385 aa  314  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  42.52 
 
 		 377 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  42.26 
 
 		 377 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  42.52 
 
 		 377 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  42.48 
 
 		 409 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  42.48 
 
 		 409 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  45.45 
 
 		 380 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  41.99 
 
 		 377 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  45.18 
 
 		 380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  41.71 
 
 		 377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  44.72 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  41.45 
 
 		 377 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  41.45 
 
 		 377 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  45.18 
 
 		 380 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  41.19 
 
 		 377 aa  299  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  41.45 
 
 		 377 aa  299  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  41.25 
 
 		 401 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  48.36 
 
 		 315 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  42.35 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  36.53 
 
 		 381 aa  232  7.000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  38.14 
 
 		 392 aa  227  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  29.65 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  29.36 
 
 		 359 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  27.3 
 
 		 494 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  33.57 
 
 		 460 aa  113  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  26.1 
 
 		 482 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  24.35 
 
 		 504 aa  107  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  25.61 
 
 		 482 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  29.31 
 
 		 401 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  25.96 
 
 		 475 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  25.62 
 
 		 384 aa  99.8  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  26.65 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  26.12 
 
 		 390 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  29.82 
 
 		 539 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  27.78 
 
 		 498 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  27.14 
 
 		 445 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  29.78 
 
 		 356 aa  92.8  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  27.45 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  28.4 
 
 		 713 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03893  putative beta-lactamase  29.64 
 
 		 363 aa  90.9  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  26.15 
 
 		 1055 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  25.07 
 
 		 407 aa  90.5  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0372  beta-lactamase  34.13 
 
 		 166 aa  90.1  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.499821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  26.8 
 
 		 388 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  32.05 
 
 		 497 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  31.06 
 
 		 491 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  29.37 
 
 		 475 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  27.11 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  27.27 
 
 		 464 aa  86.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  24.54 
 
 		 513 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  25.58 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  27.34 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  30.81 
 
 		 490 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  27.78 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  24.49 
 
 		 487 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  25.07 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  24.8 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  35.2 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.08 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  30.81 
 
 		 481 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  30.81 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  30.81 
 
 		 481 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  25.73 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  27.82 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>