More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3364 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  100 
 
 		 385 aa  794    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  80.37 
 
 		 383 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  57.22 
 
 		 388 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  53.6 
 
 		 391 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  50.84 
 
 		 384 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  52.02 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  51.97 
 
 		 385 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  51.48 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  52.02 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  51.75 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  50.93 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  48.28 
 
 		 401 aa  385  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  48.66 
 
 		 405 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  51.71 
 
 		 389 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  48.6 
 
 		 417 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  47.17 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  51.14 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  48.6 
 
 		 417 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  48.8 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  51.14 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  50 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  48.18 
 
 		 378 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  49.28 
 
 		 389 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  48.67 
 
 		 397 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  49.28 
 
 		 389 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  46.65 
 
 		 396 aa  362  8e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  48.79 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  46.4 
 
 		 390 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  46.98 
 
 		 390 aa  358  6e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  48.83 
 
 		 386 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  45.99 
 
 		 383 aa  353  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  42.71 
 
 		 387 aa  333  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  42.97 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  45.6 
 
 		 405 aa  332  9e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  45.85 
 
 		 378 aa  331  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  46.54 
 
 		 379 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  46.85 
 
 		 380 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  43.75 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  46.03 
 
 		 380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  45.21 
 
 		 380 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  41.64 
 
 		 409 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  41.64 
 
 		 409 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  41.71 
 
 		 377 aa  300  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  41.71 
 
 		 377 aa  300  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  41.44 
 
 		 377 aa  299  7e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  41.44 
 
 		 377 aa  299  7e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  43.55 
 
 		 380 aa  298  8e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  41.71 
 
 		 377 aa  298  9e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  41.18 
 
 		 377 aa  296  4e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  41.18 
 
 		 377 aa  296  6e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  41.18 
 
 		 377 aa  296  6e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  41.18 
 
 		 377 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  41.98 
 
 		 385 aa  293  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  42.02 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  44.98 
 
 		 315 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  36.95 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  37.06 
 
 		 381 aa  219  8.999999999999998e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  27.87 
 
 		 359 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  27.45 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  25.2 
 
 		 401 aa  96.3  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  26.6 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  23.71 
 
 		 494 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  25.42 
 
 		 460 aa  90.1  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  25.27 
 
 		 390 aa  89.7  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  27.68 
 
 		 345 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  28.95 
 
 		 514 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  25.07 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  25.91 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  23.41 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0372  beta-lactamase  35.03 
 
 		 166 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.499821  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  26.34 
 
 		 544 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  24.12 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  27.82 
 
 		 636 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  29.63 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  25.13 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  27.35 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  24.58 
 
 		 595 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  24.81 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  24.44 
 
 		 1032 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  25.37 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  24.1 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  27.21 
 
 		 533 aa  77.8  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  24.89 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  29.77 
 
 		 635 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  26.94 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  25.42 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  25.35 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  26.84 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  23.59 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  24.27 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  28.16 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  29.27 
 
 		 578 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  28.25 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  26.94 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  25.07 
 
 		 669 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.94 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  26.94 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  24.57 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.32 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  28.9 
 
 		 778 aa  74.3  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>