More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7532 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  85.86 
 
 
389 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  84.02 
 
 
389 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  100 
 
 
389 aa  791    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  85.6 
 
 
389 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  86.6 
 
 
389 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  85.6 
 
 
389 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  74.04 
 
 
389 aa  585  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  61.76 
 
 
391 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  60.57 
 
 
388 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  57.39 
 
 
384 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  51.67 
 
 
385 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  53.45 
 
 
378 aa  391  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  53.48 
 
 
386 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  48.97 
 
 
390 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  47.47 
 
 
394 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  47.47 
 
 
394 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  47.73 
 
 
394 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  47.2 
 
 
394 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  47.01 
 
 
401 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  49.72 
 
 
385 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  49.08 
 
 
390 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  47.86 
 
 
405 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  44.83 
 
 
394 aa  365  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  45.28 
 
 
417 aa  359  4e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  49.72 
 
 
383 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  44.72 
 
 
417 aa  354  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  47.48 
 
 
387 aa  338  8e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  45.5 
 
 
388 aa  338  9e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  43.42 
 
 
396 aa  333  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  46.49 
 
 
387 aa  330  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  45.97 
 
 
397 aa  325  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  44.33 
 
 
387 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  45.12 
 
 
397 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  48.16 
 
 
405 aa  325  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  39.64 
 
 
383 aa  324  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  43.38 
 
 
385 aa  318  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  44.51 
 
 
378 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  46.01 
 
 
380 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  45.73 
 
 
380 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  45.45 
 
 
380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  45.18 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  41.1 
 
 
377 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  41.36 
 
 
377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  42.15 
 
 
409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  42.15 
 
 
409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  41.1 
 
 
377 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  40.84 
 
 
377 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  40.84 
 
 
377 aa  299  7e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  40.84 
 
 
377 aa  299  7e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  49.35 
 
 
315 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  40.58 
 
 
377 aa  297  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  40.31 
 
 
377 aa  298  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  40.31 
 
 
377 aa  296  6e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  38.34 
 
 
401 aa  279  5e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  41.18 
 
 
380 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  36.53 
 
 
381 aa  227  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  36.09 
 
 
392 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  29.21 
 
 
359 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  28.29 
 
 
359 aa  153  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  26.01 
 
 
494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  32.52 
 
 
460 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  27 
 
 
504 aa  110  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  26.25 
 
 
482 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  25.75 
 
 
482 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  29.53 
 
 
401 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  25.8 
 
 
498 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  25.25 
 
 
475 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0372  beta-lactamase  35.12 
 
 
166 aa  93.6  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.499821  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  28.57 
 
 
390 aa  93.2  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  32.2 
 
 
445 aa  93.2  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  27.68 
 
 
381 aa  93.2  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  26.8 
 
 
539 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  29.59 
 
 
650 aa  90.5  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  28.96 
 
 
669 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  29.07 
 
 
713 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  24.38 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  28.25 
 
 
513 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  28.74 
 
 
513 aa  86.7  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  24.61 
 
 
407 aa  86.3  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  27.27 
 
 
513 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  29.01 
 
 
417 aa  84  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  26.87 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  27.33 
 
 
491 aa  83.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  24.29 
 
 
486 aa  82.8  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  25.63 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.44 
 
 
514 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  28.35 
 
 
513 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  27.97 
 
 
464 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  28.26 
 
 
475 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03893  putative beta-lactamase  25.76 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  25 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  24.44 
 
 
487 aa  80.1  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  28.43 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  30.74 
 
 
658 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  23.95 
 
 
1055 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  24.32 
 
 
453 aa  79.7  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  29.8 
 
 
601 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  30.33 
 
 
497 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  28.88 
 
 
437 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  24.35 
 
 
477 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>