More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4621 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  95.76 
 
 		 377 aa  743    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  97.88 
 
 		 377 aa  759    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  95.76 
 
 		 377 aa  743    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  95.76 
 
 		 377 aa  744    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  96.82 
 
 		 377 aa  754    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  96.29 
 
 		 377 aa  747    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  100 
 
 		 377 aa  776    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  96.02 
 
 		 377 aa  748    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  95.49 
 
 		 377 aa  740    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  76.32 
 
 		 409 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  76.32 
 
 		 409 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  72.63 
 
 		 385 aa  583  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  46.9 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  44.94 
 
 		 390 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  43.72 
 
 		 397 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  44.08 
 
 		 378 aa  323  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  44.1 
 
 		 386 aa  322  9.000000000000001e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  42.97 
 
 		 390 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  44.57 
 
 		 388 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  42.41 
 
 		 397 aa  316  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  43.09 
 
 		 391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  42.18 
 
 		 389 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  42.82 
 
 		 387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  43.1 
 
 		 387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  41.62 
 
 		 389 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  40.85 
 
 		 396 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  39.79 
 
 		 383 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  39.25 
 
 		 394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  39.52 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  40.8 
 
 		 405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  39.25 
 
 		 394 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  39.25 
 
 		 394 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  43.26 
 
 		 389 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  38.71 
 
 		 394 aa  300  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  41.18 
 
 		 417 aa  299  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  41.46 
 
 		 417 aa  299  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  41.44 
 
 		 385 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  43.26 
 
 		 389 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  43.26 
 
 		 389 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  44.51 
 
 		 405 aa  296  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  38.18 
 
 		 401 aa  296  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  43.66 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  41.27 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  41.46 
 
 		 389 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  40.27 
 
 		 385 aa  288  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  41.03 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  42.12 
 
 		 401 aa  283  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  39.14 
 
 		 378 aa  278  9e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  40 
 
 		 379 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  41.26 
 
 		 387 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  39.5 
 
 		 380 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  39.39 
 
 		 380 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  39.94 
 
 		 380 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  39.47 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  38.33 
 
 		 392 aa  236  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  40.07 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  35.9 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  28 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  27.47 
 
 		 359 aa  145  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  27.48 
 
 		 494 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  28.12 
 
 		 460 aa  113  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  26.65 
 
 		 401 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  26.75 
 
 		 381 aa  106  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  27.62 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  27.55 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.15 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.4 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  25.21 
 
 		 482 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  24.93 
 
 		 482 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  30.07 
 
 		 490 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  26.7 
 
 		 1032 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.55 
 
 		 514 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  29.55 
 
 		 636 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  25.8 
 
 		 505 aa  94  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  25.48 
 
 		 1055 aa  93.6  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  29.88 
 
 		 483 aa  93.2  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  25.54 
 
 		 407 aa  93.2  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3141  beta-lactamase  26.92 
 
 		 447 aa  92.8  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  26.89 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  28.67 
 
 		 481 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  29.57 
 
 		 475 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  23.82 
 
 		 635 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  25.42 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  26.65 
 
 		 674 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  28.67 
 
 		 481 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  26.51 
 
 		 388 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  29.82 
 
 		 543 aa  90.1  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  29.82 
 
 		 543 aa  90.1  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  29.76 
 
 		 483 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  26.35 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  28.47 
 
 		 481 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  27.86 
 
 		 481 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  27.14 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  25.68 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  28.96 
 
 		 463 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  24.48 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  26.15 
 
 		 498 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  22.19 
 
 		 453 aa  86.3  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  27.7 
 
 		 650 aa  86.7  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  27.92 
 
 		 361 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>