More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2273 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  100 
 
 		 378 aa  779    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  52.39 
 
 		 388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  52.42 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  52.42 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  52.14 
 
 		 394 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  52.42 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  52.01 
 
 		 389 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  51.28 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  53.45 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  51.86 
 
 		 391 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  49.86 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  50 
 
 		 405 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  50.28 
 
 		 401 aa  381  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  47.59 
 
 		 385 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  52.46 
 
 		 389 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  49.01 
 
 		 417 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  52.46 
 
 		 389 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  52.46 
 
 		 389 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  50.57 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  48.56 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  45.55 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  48.18 
 
 		 385 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  45.5 
 
 		 384 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  47.16 
 
 		 386 aa  361  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  46.74 
 
 		 388 aa  360  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  47.47 
 
 		 397 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  46.81 
 
 		 390 aa  353  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  48.16 
 
 		 378 aa  352  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  47.61 
 
 		 383 aa  348  7e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  48.46 
 
 		 387 aa  345  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  46.07 
 
 		 397 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  46.33 
 
 		 383 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  43.18 
 
 		 387 aa  332  6e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  42.59 
 
 		 387 aa  332  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  44.7 
 
 		 405 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  43.65 
 
 		 379 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  41.71 
 
 		 396 aa  312  7.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  43.23 
 
 		 401 aa  299  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  43.53 
 
 		 380 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  43.09 
 
 		 380 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  40.31 
 
 		 385 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  43.18 
 
 		 380 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  40.29 
 
 		 377 aa  285  9e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  40.57 
 
 		 377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  40.29 
 
 		 377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  40.29 
 
 		 377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  40.29 
 
 		 377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  40.29 
 
 		 377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  39.71 
 
 		 377 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  37.89 
 
 		 409 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  37.89 
 
 		 409 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  39.71 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  39.14 
 
 		 377 aa  279  7e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  40.94 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  38.87 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  42.16 
 
 		 315 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  30.49 
 
 		 392 aa  196  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  28.53 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  28.95 
 
 		 359 aa  155  9e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  26 
 
 		 494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  25.57 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  25.88 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  26.26 
 
 		 498 aa  94  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  28.81 
 
 		 567 aa  93.6  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  26.3 
 
 		 405 aa  93.2  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  26.2 
 
 		 526 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.91 
 
 		 595 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  27.56 
 
 		 513 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  23.24 
 
 		 1055 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  24.72 
 
 		 544 aa  89.7  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  24.46 
 
 		 520 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  25.06 
 
 		 460 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  25.38 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  27.75 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.57 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  27.17 
 
 		 513 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  26.77 
 
 		 513 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  24.79 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  30.58 
 
 		 524 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  27.05 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  27.46 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  26.32 
 
 		 530 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  27.46 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  27.24 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  27.85 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0372  beta-lactamase  31.68 
 
 		 166 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.499821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  27.85 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  23.65 
 
 		 475 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  24.79 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.85 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  25.4 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  27.85 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  23.68 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  28.57 
 
 		 635 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  27.92 
 
 		 533 aa  80.9  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.2 
 
 		 601 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3047  beta-lactamase  28.43 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  25 
 
 		 517 aa  80.5  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  30.61 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>