More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0193 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  100 
 
 		 387 aa  776    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  49.73 
 
 		 391 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  49.08 
 
 		 388 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  49.44 
 
 		 386 aa  349  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  48.46 
 
 		 378 aa  345  8e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  47.26 
 
 		 405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  46.67 
 
 		 401 aa  341  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  45.99 
 
 		 384 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  49.71 
 
 		 389 aa  336  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  50.72 
 
 		 389 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  45.5 
 
 		 390 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  50.43 
 
 		 389 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  50.43 
 
 		 389 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  48.84 
 
 		 389 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  48.55 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  48.6 
 
 		 389 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  43.75 
 
 		 385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  44.21 
 
 		 385 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  45.89 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  45.89 
 
 		 417 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  44.53 
 
 		 394 aa  324  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  47.59 
 
 		 378 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  44.18 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  43.92 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  48.55 
 
 		 390 aa  322  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  43.62 
 
 		 396 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  46.83 
 
 		 387 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  44.18 
 
 		 394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  43.92 
 
 		 394 aa  319  6e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  47.08 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  44.89 
 
 		 388 aa  316  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  47.11 
 
 		 397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  49.71 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  44.95 
 
 		 385 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  44.63 
 
 		 383 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  46.38 
 
 		 397 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  49.19 
 
 		 315 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  41.4 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  44.62 
 
 		 401 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  41.8 
 
 		 377 aa  285  7e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  42.08 
 
 		 377 aa  285  9e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  42.33 
 
 		 377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  42.33 
 
 		 377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  44.61 
 
 		 380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  45.48 
 
 		 380 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  41.53 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  44.93 
 
 		 380 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  41.4 
 
 		 409 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  41.4 
 
 		 409 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  41.53 
 
 		 377 aa  280  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  43.71 
 
 		 379 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  42.05 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  44.66 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  41.26 
 
 		 377 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  41.26 
 
 		 377 aa  276  5e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  37.68 
 
 		 392 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  34.47 
 
 		 381 aa  209  4e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  27.08 
 
 		 359 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  26.3 
 
 		 359 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  33.22 
 
 		 650 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  28.77 
 
 		 498 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  28.28 
 
 		 401 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  30.15 
 
 		 460 aa  87  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.39 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  30.43 
 
 		 635 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  39.88 
 
 		 513 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  29.27 
 
 		 601 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0372  beta-lactamase  32.97 
 
 		 166 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.499821  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3047  beta-lactamase  32.04 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  29.43 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  23.56 
 
 		 494 aa  80.1  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  29.3 
 
 		 669 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  30.25 
 
 		 674 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  24.93 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.22 
 
 		 595 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  25.49 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  29.59 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  36.76 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  29.74 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  27.91 
 
 		 544 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  31.05 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  29.84 
 
 		 513 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1013  beta-lactamase  30.36 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  25.34 
 
 		 567 aa  73.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31 
 
 		 582 aa  73.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  23.91 
 
 		 505 aa  73.6  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  29.19 
 
 		 514 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0784  beta-lactamase  30.48 
 
 		 638 aa  73.2  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.68 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.04 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  26.87 
 
 		 588 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  28.86 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  28.52 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  29.54 
 
 		 590 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  31.66 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  30.04 
 
 		 513 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  24.56 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  26.76 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  25.73 
 
 		 610 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.29 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>