More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2585 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  100 
 
 
390 aa  797    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  61.67 
 
 
386 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  58.76 
 
 
390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  57.65 
 
 
388 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  52.56 
 
 
397 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  53.59 
 
 
378 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  52.2 
 
 
397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  49.35 
 
 
391 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  49.86 
 
 
383 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  48.75 
 
 
388 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  47.4 
 
 
394 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  47.14 
 
 
394 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  47.66 
 
 
394 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  46.88 
 
 
394 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  49.58 
 
 
387 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  46.86 
 
 
401 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  51.58 
 
 
405 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  50.84 
 
 
389 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  49.01 
 
 
387 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  48.55 
 
 
396 aa  372  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  49.58 
 
 
389 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  44.7 
 
 
394 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  49.3 
 
 
389 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  47.85 
 
 
385 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  49.15 
 
 
389 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  46.88 
 
 
378 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  49.44 
 
 
389 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  49.44 
 
 
389 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  47.62 
 
 
384 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  44.15 
 
 
405 aa  363  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  51.66 
 
 
379 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  44.47 
 
 
417 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  46.98 
 
 
385 aa  358  6e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  45.99 
 
 
389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  44.44 
 
 
417 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  47.25 
 
 
383 aa  349  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  49.04 
 
 
380 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  49.04 
 
 
380 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  45.5 
 
 
387 aa  333  4e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  48.21 
 
 
380 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  42.78 
 
 
409 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  42.78 
 
 
409 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  43.35 
 
 
385 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  43.86 
 
 
377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  43.08 
 
 
377 aa  324  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  42.56 
 
 
377 aa  323  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  42.82 
 
 
377 aa  323  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  42.3 
 
 
377 aa  322  8e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  43.08 
 
 
377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  43.08 
 
 
377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  42.97 
 
 
377 aa  320  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  42.3 
 
 
377 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  36.99 
 
 
401 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  43.79 
 
 
315 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  40 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  37.63 
 
 
392 aa  257  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  37.11 
 
 
381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  26.4 
 
 
359 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  26.4 
 
 
359 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  25.13 
 
 
494 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  25 
 
 
460 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  25 
 
 
401 aa  90.1  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  24.4 
 
 
513 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  29.72 
 
 
405 aa  87  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  24.01 
 
 
513 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  26.59 
 
 
456 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  25.71 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  25 
 
 
1055 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  23.32 
 
 
513 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  25.54 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  29.76 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  23.63 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  28.88 
 
 
635 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  27.81 
 
 
650 aa  79.7  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  24.78 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  22.85 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  26.76 
 
 
460 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  22.87 
 
 
513 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.5 
 
 
484 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  29.19 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  20.79 
 
 
498 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  22.14 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.33 
 
 
514 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  25.26 
 
 
574 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  25.25 
 
 
520 aa  73.2  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0372  beta-lactamase  29.07 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.499821  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  23.7 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  31.75 
 
 
717 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3141  beta-lactamase  24.48 
 
 
447 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  29.15 
 
 
330 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  24.76 
 
 
487 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  23.6 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  22.9 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  27.75 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  24.73 
 
 
566 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  24.16 
 
 
501 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  23.08 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3689  beta-lactamase  28.23 
 
 
422 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  27.36 
 
 
464 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  23.74 
 
 
491 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>