More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5057 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  100 
 
 		 388 aa  800    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  88.14 
 
 		 391 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  61.24 
 
 		 389 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  62.46 
 
 		 384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  59.95 
 
 		 389 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  60.21 
 
 		 389 aa  461  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  61.5 
 
 		 385 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  58.96 
 
 		 389 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  58.44 
 
 		 389 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  58.18 
 
 		 389 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  58.18 
 
 		 389 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  57.22 
 
 		 385 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  55.24 
 
 		 394 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  55.24 
 
 		 394 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  55.24 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  54.67 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  56.07 
 
 		 383 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  53.11 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  52.27 
 
 		 401 aa  408  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  55.06 
 
 		 386 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  53.56 
 
 		 390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  51.74 
 
 		 405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  53.15 
 
 		 378 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  51.27 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  51.27 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  49.6 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  48.75 
 
 		 390 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  48.33 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  48.75 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  48.18 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  47 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  47.52 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  49.08 
 
 		 387 aa  368  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  50.57 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  47.74 
 
 		 378 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  50.14 
 
 		 405 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  44.47 
 
 		 377 aa  323  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  43.52 
 
 		 409 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  43.52 
 
 		 409 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  44.21 
 
 		 377 aa  323  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  44.21 
 
 		 377 aa  321  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  44.36 
 
 		 385 aa  321  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  44.21 
 
 		 377 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  44.57 
 
 		 377 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  43.95 
 
 		 377 aa  319  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  43.68 
 
 		 377 aa  316  5e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  43.42 
 
 		 377 aa  315  7e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  43.42 
 
 		 377 aa  315  7e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  43.09 
 
 		 380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  42.54 
 
 		 380 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  42.74 
 
 		 380 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  41.97 
 
 		 379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  42.2 
 
 		 401 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  46.2 
 
 		 315 aa  292  8e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  45.19 
 
 		 380 aa  288  8e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  35.6 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  37.43 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  26.86 
 
 		 359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  26.86 
 
 		 359 aa  136  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  27.48 
 
 		 494 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  28.09 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0372  beta-lactamase  38.92 
 
 		 166 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.499821  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  26.54 
 
 		 390 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  25.76 
 
 		 401 aa  96.7  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  33.75 
 
 		 514 aa  94  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  29 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  25.81 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.25 
 
 		 385 aa  86.7  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  21.71 
 
 		 426 aa  86.7  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.25 
 
 		 385 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  27.64 
 
 		 356 aa  86.3  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  29.13 
 
 		 477 aa  86.3  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4667  beta-lactamase  24.8 
 
 		 498 aa  86.3  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  25.98 
 
 		 513 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  28.84 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  23.56 
 
 		 498 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  28.51 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  26.42 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  29.15 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  24.73 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  25.29 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  30.71 
 
 		 476 aa  82.8  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  26.26 
 
 		 482 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  26.26 
 
 		 513 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.41 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  26.54 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.78 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.55 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  26.26 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  23.8 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  24.65 
 
 		 601 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  30.37 
 
 		 720 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  27.22 
 
 		 1055 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  25.34 
 
 		 503 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.69 
 
 		 442 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  25.93 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.13 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  27.92 
 
 		 669 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.34 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  23.88 
 
 		 1032 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>