More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4667 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4667  beta-lactamase  100 
 
 		 498 aa  999    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  44.33 
 
 		 491 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  32.93 
 
 		 404 aa  184  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  26.69 
 
 		 504 aa  182  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  31.84 
 
 		 390 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  33.99 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  25.16 
 
 		 578 aa  127  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  24.43 
 
 		 487 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  26.22 
 
 		 359 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  27.41 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  25.56 
 
 		 496 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  25.51 
 
 		 359 aa  106  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  30.79 
 
 		 407 aa  97.1  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  29.01 
 
 		 460 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  24.79 
 
 		 510 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  29.75 
 
 		 381 aa  89.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  25.55 
 
 		 513 aa  88.2  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  28.21 
 
 		 401 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  25.55 
 
 		 513 aa  87.8  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  25.71 
 
 		 513 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  25.76 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  25.76 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  25.76 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  25.76 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  25.76 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  25.76 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0417  beta-lactam binding protein AmpH  26.46 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.144637 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  25.76 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0844  beta-lactam binding protein AmpH  25.39 
 
 		 388 aa  86.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0659143 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  24.8 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0409  beta-lactam binding protein AmpH  26.15 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225371  hitchhiker  0.000170283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1136  beta-lactamase  29.13 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  25.23 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0429  beta-lactam binding protein AmpH  26.15 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.524845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0411  beta-lactam binding protein AmpH  26.15 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0471  beta-lactam binding protein AmpH  26.15 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598882  normal  0.181498 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00323  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  25.45 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00327  hypothetical protein  25.45 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  24.5 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  25.21 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  25.38 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  29.03 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6651  beta-lactam binding protein AmpH  28.81 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  26.89 
 
 		 543 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  25.39 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  23.18 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  22.31 
 
 		 498 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  22.31 
 
 		 498 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  27.25 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  23.15 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  22.83 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  22.83 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  26.89 
 
 		 345 aa  76.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  26.21 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0636  beta-lactam binding protein AmpH  25.96 
 
 		 380 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.259822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  23.66 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  23.75 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  23.66 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  24 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  25.8 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  23.48 
 
 		 595 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.56 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  25.66 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  26.1 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  30.84 
 
 		 513 aa  74.7  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  28.47 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  27.6 
 
 		 657 aa  72.8  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  20.59 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  23.38 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.54 
 
 		 480 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  23.5 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  22.5 
 
 		 526 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  25.63 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  23.29 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.69 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  22.66 
 
 		 482 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  23.22 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  23.96 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2550  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.32 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  24.1 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  23.96 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  22.75 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  23.75 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2836  beta-lactam binding protein AmpH  25.77 
 
 		 388 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  24.71 
 
 		 385 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1447  beta-lactam binding protein AmpH  25.77 
 
 		 383 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000414942  normal  0.794569 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2758  beta-lactam binding protein AmpH  25.77 
 
 		 388 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277431  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  24.78 
 
 		 389 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  22.99 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  22.12 
 
 		 591 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  24.93 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  27.25 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  22.41 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  22.79 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  21.85 
 
 		 477 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  25.24 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  25.43 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  24.37 
 
 		 566 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  22.89 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  23.55 
 
 		 475 aa  67  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>