More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0293 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00323  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  99.74 
 
 		 385 aa  792    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  100 
 
 		 385 aa  796    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0471  beta-lactam binding protein AmpH  91.69 
 
 		 385 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598882  normal  0.181498 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  100 
 
 		 385 aa  796    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0411  beta-lactam binding protein AmpH  91.43 
 
 		 385 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  100 
 
 		 385 aa  796    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  100 
 
 		 385 aa  796    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  100 
 
 		 385 aa  796    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00327  hypothetical protein  99.74 
 
 		 385 aa  792    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  100 
 
 		 385 aa  796    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0417  beta-lactam binding protein AmpH  91.17 
 
 		 385 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.144637 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0844  beta-lactam binding protein AmpH  86.23 
 
 		 388 aa  695    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0659143 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  100 
 
 		 385 aa  796    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0429  beta-lactam binding protein AmpH  91.43 
 
 		 385 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.524845 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0409  beta-lactam binding protein AmpH  91.43 
 
 		 385 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225371  hitchhiker  0.000170283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0636  beta-lactam binding protein AmpH  64.57 
 
 		 380 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.259822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2836  beta-lactam binding protein AmpH  63.11 
 
 		 388 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2758  beta-lactam binding protein AmpH  63.11 
 
 		 388 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277431  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1447  beta-lactam binding protein AmpH  63.11 
 
 		 383 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000414942  normal  0.794569 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  40.53 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6651  beta-lactam binding protein AmpH  39.68 
 
 		 369 aa  249  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  34.46 
 
 		 381 aa  190  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  26.87 
 
 		 404 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  30.23 
 
 		 494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  28.49 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  26.65 
 
 		 501 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  24.93 
 
 		 446 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  28.46 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  26.47 
 
 		 662 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  30.17 
 
 		 498 aa  97.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  28.52 
 
 		 401 aa  97.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  30.91 
 
 		 417 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  32.13 
 
 		 450 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  26.88 
 
 		 381 aa  93.6  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25.65 
 
 		 487 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  22.75 
 
 		 359 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  29.01 
 
 		 717 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  25.6 
 
 		 491 aa  89.7  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  23.34 
 
 		 409 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  23.34 
 
 		 409 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  29.89 
 
 		 381 aa  89.4  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  25.08 
 
 		 595 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.18 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  22.66 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  28.68 
 
 		 391 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  23.66 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  23.66 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  28.32 
 
 		 574 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  30.48 
 
 		 524 aa  86.3  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4667  beta-lactamase  25.76 
 
 		 498 aa  86.3  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  32.29 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  23.66 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  26.21 
 
 		 345 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  22.47 
 
 		 600 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  27.75 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  23.87 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.1 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  29.17 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  26.07 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  32.21 
 
 		 793 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  27.01 
 
 		 674 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  24.78 
 
 		 504 aa  82.8  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  28.28 
 
 		 694 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  24.43 
 
 		 559 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  25.57 
 
 		 578 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  26.51 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  23.12 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  26.98 
 
 		 519 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  24.01 
 
 		 715 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  24.76 
 
 		 347 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  26.08 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  22.85 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  25.94 
 
 		 601 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  26.4 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.3 
 
 		 544 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.19 
 
 		 582 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  27.16 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  22.85 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  24.17 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  28.12 
 
 		 691 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  29.91 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  22.85 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  22.85 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  30.77 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  22.85 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  24.35 
 
 		 529 aa  79.7  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  27.11 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  24.7 
 
 		 498 aa  79.3  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  22.9 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  28.15 
 
 		 537 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  22.9 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  29.39 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  28.22 
 
 		 784 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  28.96 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  27.01 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  29.62 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  22.9 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  22.92 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.98 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  26.59 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>