More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0339 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  100 
 
 
385 aa  796    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  78.16 
 
 
409 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  78.16 
 
 
409 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0743599 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  72.89 
 
 
377 aa  585  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  73.42 
 
 
377 aa  585  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.106194 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  72.63 
 
 
377 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  72.63 
 
 
377 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  72.63 
 
 
377 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  72.89 
 
 
377 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  72.89 
 
 
377 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  72.63 
 
 
377 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  72.63 
 
 
377 aa  579  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  47.62 
 
 
388 aa  360  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  45.89 
 
 
386 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  43.35 
 
 
390 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  44.01 
 
 
387 aa  330  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  44.95 
 
 
390 aa  329  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  44.24 
 
 
397 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  43.57 
 
 
387 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  43.92 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  44.74 
 
 
389 aa  323  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  44.36 
 
 
388 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  44.21 
 
 
389 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  43.98 
 
 
391 aa  318  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  44.95 
 
 
387 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  42.94 
 
 
378 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  46.05 
 
 
389 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  46.05 
 
 
389 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  44.92 
 
 
389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  44.39 
 
 
405 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  41.87 
 
 
396 aa  308  6.999999999999999e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  45.48 
 
 
389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  42.41 
 
 
389 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  43.14 
 
 
379 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  38.48 
 
 
383 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  41.98 
 
 
385 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  42 
 
 
378 aa  292  9e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  41.99 
 
 
380 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  41.44 
 
 
380 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  41.44 
 
 
380 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  39.31 
 
 
394 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  41.88 
 
 
384 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  39.58 
 
 
394 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  39.31 
 
 
394 aa  288  9e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  39.52 
 
 
405 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  39.05 
 
 
394 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  40.67 
 
 
385 aa  285  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  38.79 
 
 
394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  39.22 
 
 
417 aa  279  7e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  38.94 
 
 
417 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  37.83 
 
 
401 aa  277  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  39.68 
 
 
383 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  37.3 
 
 
401 aa  263  6e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  38.86 
 
 
392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  35.73 
 
 
380 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  38.89 
 
 
315 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  33.51 
 
 
381 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  24.6 
 
 
359 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  25.07 
 
 
359 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  25.65 
 
 
494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  26.06 
 
 
460 aa  106  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  24.87 
 
 
404 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  26.58 
 
 
407 aa  99.8  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  25.41 
 
 
498 aa  97.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  27.45 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  26.1 
 
 
381 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  30.59 
 
 
477 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  26.51 
 
 
544 aa  94.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  26.24 
 
 
390 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  24.74 
 
 
635 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  29.92 
 
 
490 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3141  beta-lactamase  24.77 
 
 
447 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  28.1 
 
 
481 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  28.1 
 
 
481 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  24.8 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  24.32 
 
 
600 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  27.45 
 
 
481 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  26.61 
 
 
401 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  24.93 
 
 
491 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  23.33 
 
 
482 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  23.01 
 
 
453 aa  87.8  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  30.51 
 
 
636 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  25.14 
 
 
362 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  25.37 
 
 
356 aa  86.7  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  27.68 
 
 
483 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  27.36 
 
 
463 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  26.2 
 
 
483 aa  86.7  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  27.6 
 
 
388 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  23.08 
 
 
482 aa  86.3  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  27.45 
 
 
481 aa  86.3  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.22 
 
 
514 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00323  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  24.94 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  23.87 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  26.98 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  23.87 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  23.87 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  23.87 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  23.87 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00327  hypothetical protein  24.94 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  23.98 
 
 
1055 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>