More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4637 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  100 
 
 		 491 aa  1009    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4667  beta-lactamase  44.76 
 
 		 498 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  46.11 
 
 		 404 aa  326  6e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  40.11 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  31.26 
 
 		 504 aa  238  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  36.08 
 
 		 352 aa  199  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  29.6 
 
 		 496 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  30.04 
 
 		 578 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  28 
 
 		 494 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  31.25 
 
 		 487 aa  141  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  28.88 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  26.79 
 
 		 359 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  26.76 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  27.67 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0471  beta-lactam binding protein AmpH  25.52 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598882  normal  0.181498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  23.83 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  26.51 
 
 		 373 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0411  beta-lactam binding protein AmpH  25.52 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  26.33 
 
 		 359 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0429  beta-lactam binding protein AmpH  25.52 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.524845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0417  beta-lactam binding protein AmpH  25.52 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.144637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0409  beta-lactam binding protein AmpH  25.26 
 
 		 385 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225371  hitchhiker  0.000170283 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  27.75 
 
 		 498 aa  96.7  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  27.75 
 
 		 498 aa  96.7  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  27.37 
 
 		 417 aa  96.7  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0036  TPR repeat-containing protein  36.75 
 
 		 514 aa  93.6  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83786  normal  0.225653 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  24.61 
 
 		 385 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  24.61 
 
 		 385 aa  93.6  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  24.61 
 
 		 385 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  24.61 
 
 		 385 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  24.61 
 
 		 385 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  24.61 
 
 		 385 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  24.61 
 
 		 385 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  27.74 
 
 		 381 aa  93.6  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00323  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  24.35 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  27.06 
 
 		 450 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00327  hypothetical protein  24.35 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  24.46 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0844  beta-lactam binding protein AmpH  25.5 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0659143 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  24.46 
 
 		 477 aa  91.3  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6651  beta-lactam binding protein AmpH  24.86 
 
 		 369 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  25.13 
 
 		 385 aa  89  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  25.16 
 
 		 498 aa  88.2  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  30.83 
 
 		 389 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1447  beta-lactam binding protein AmpH  24.65 
 
 		 383 aa  87  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000414942  normal  0.794569 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2758  beta-lactam binding protein AmpH  24.65 
 
 		 388 aa  87  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277431  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2836  beta-lactam binding protein AmpH  24.65 
 
 		 388 aa  87  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  25.97 
 
 		 446 aa  87  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1136  beta-lactamase  28.71 
 
 		 357 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  26.82 
 
 		 497 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  24.33 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  26.18 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  22.77 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2550  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.27 
 
 		 489 aa  83.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  26.9 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  23.33 
 
 		 377 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  25.87 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  26.69 
 
 		 657 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  31.54 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  31.54 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  24.58 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  24.58 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0636  beta-lactam binding protein AmpH  22.38 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.259822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  26.02 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  22.94 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  24.32 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  22.94 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  26.45 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  25.69 
 
 		 543 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  25.69 
 
 		 543 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  22.82 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.28 
 
 		 442 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  24.11 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  22.68 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  24.12 
 
 		 513 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  25.38 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  22.82 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  22.94 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  22.94 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  23.47 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  26.02 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  22.94 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  27.27 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.2 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  25.14 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  27.13 
 
 		 513 aa  77  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  26.12 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  25.47 
 
 		 543 aa  77  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  24.86 
 
 		 848 aa  77  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3476  beta-lactamase  25.99 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  26.24 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  26.12 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.12 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  26.12 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  25.77 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  25.07 
 
 		 389 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  30.45 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  23.47 
 
 		 513 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  23.78 
 
 		 513 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  25.43 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>