More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6008 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  100 
 
 		 389 aa  783    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  76.09 
 
 		 389 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  75.84 
 
 		 389 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  74.16 
 
 		 389 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  75.84 
 
 		 389 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  73.64 
 
 		 389 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  74.04 
 
 		 389 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  58.76 
 
 		 391 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  58.96 
 
 		 388 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  50.91 
 
 		 385 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  53.37 
 
 		 384 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  49.74 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  48.15 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  48.15 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  48.15 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  47.88 
 
 		 394 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  51.12 
 
 		 386 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  46.75 
 
 		 405 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  46.83 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  48.8 
 
 		 385 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  50.26 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  50.14 
 
 		 378 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  47.3 
 
 		 417 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  47.41 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  49.86 
 
 		 383 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  45.99 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  47.27 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  47.23 
 
 		 387 aa  345  7e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  47.49 
 
 		 387 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  44.6 
 
 		 383 aa  343  4e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  49.58 
 
 		 405 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  48.6 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  41.32 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  44.56 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  43.93 
 
 		 397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  45.63 
 
 		 379 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  42.41 
 
 		 409 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  42.41 
 
 		 409 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  42.25 
 
 		 378 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  42.27 
 
 		 401 aa  301  9e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  42.41 
 
 		 385 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  42.54 
 
 		 377 aa  298  8e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  43.41 
 
 		 380 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  43.25 
 
 		 380 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  41.27 
 
 		 377 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  42.66 
 
 		 377 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  42.25 
 
 		 377 aa  292  6e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  41.97 
 
 		 377 aa  292  8e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  43.25 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  42.09 
 
 		 377 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  42.09 
 
 		 377 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  41.69 
 
 		 377 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  41.97 
 
 		 377 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  48.36 
 
 		 315 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  44.02 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  33.94 
 
 		 381 aa  219  7e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  36.47 
 
 		 392 aa  219  7.999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  28.77 
 
 		 359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  28.49 
 
 		 359 aa  163  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  26.22 
 
 		 494 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  32.87 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  30.09 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  26.69 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  25.84 
 
 		 482 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  29.9 
 
 		 539 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  25.32 
 
 		 482 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  28.74 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  24.34 
 
 		 498 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  23.14 
 
 		 504 aa  97.8  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  25.4 
 
 		 513 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  25.79 
 
 		 513 aa  97.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  27.12 
 
 		 475 aa  96.7  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  24.81 
 
 		 513 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  25.19 
 
 		 404 aa  96.3  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  30.99 
 
 		 650 aa  93.6  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  32.75 
 
 		 635 aa  93.2  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  27.97 
 
 		 513 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  28.57 
 
 		 445 aa  90.5  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  24.72 
 
 		 385 aa  90.1  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  31.27 
 
 		 417 aa  89.7  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  24.48 
 
 		 381 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  25.21 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.93 
 
 		 514 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  32.66 
 
 		 475 aa  87.4  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  27.07 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  25.21 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  30.83 
 
 		 530 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  27.62 
 
 		 720 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0372  beta-lactamase  34.13 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.499821  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  25.54 
 
 		 567 aa  83.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  30.08 
 
 		 601 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  27.59 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  25.83 
 
 		 426 aa  82.8  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03893  putative beta-lactamase  25.54 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  28.74 
 
 		 669 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  26.08 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  26.08 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  28.57 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  26.08 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  26.08 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>