More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5292 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  100 
 
 		 315 aa  634    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  48.36 
 
 		 384 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  49.19 
 
 		 387 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  46.43 
 
 		 391 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  49.35 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  48.68 
 
 		 389 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  48.37 
 
 		 387 aa  293  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  48.38 
 
 		 390 aa  292  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  46.2 
 
 		 388 aa  292  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  47.06 
 
 		 387 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  48.03 
 
 		 389 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  45.28 
 
 		 401 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  48.36 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  48.2 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  45.42 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  48.2 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  48.2 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  45.39 
 
 		 385 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  44.74 
 
 		 417 aa  279  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  44.95 
 
 		 405 aa  279  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  44.3 
 
 		 388 aa  279  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  43.79 
 
 		 390 aa  276  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  44.08 
 
 		 417 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  49.17 
 
 		 405 aa  276  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  44.98 
 
 		 385 aa  275  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  44.26 
 
 		 394 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  43.93 
 
 		 394 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  46.43 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  43.93 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  43.93 
 
 		 394 aa  269  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  46.43 
 
 		 397 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  43.93 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  42.16 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  44.41 
 
 		 383 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  47.8 
 
 		 401 aa  258  8e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  44.16 
 
 		 378 aa  258  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  40.13 
 
 		 396 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  39.6 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  42.43 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  41.69 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  42.3 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  41.69 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  41.69 
 
 		 380 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  40.07 
 
 		 377 aa  230  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  40.07 
 
 		 377 aa  229  7e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  40.07 
 
 		 377 aa  228  8e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  40.07 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  39.87 
 
 		 377 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  39.87 
 
 		 377 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  39.87 
 
 		 377 aa  226  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  39.54 
 
 		 377 aa  225  7e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  39.09 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  38.89 
 
 		 385 aa  218  8.999999999999998e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  37.13 
 
 		 409 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  37.13 
 
 		 409 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  38.08 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  33.78 
 
 		 381 aa  161  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  28.03 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  28.84 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  25.08 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  29.8 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  23.84 
 
 		 494 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  30.17 
 
 		 460 aa  76.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  32.83 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0372  beta-lactamase  30.67 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.499821  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  24.84 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  29.02 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4667  beta-lactamase  25.24 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  25.39 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  27.6 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  24.92 
 
 		 487 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  26.03 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  22.93 
 
 		 426 aa  65.9  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  30 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  24.22 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3476  beta-lactamase  31.19 
 
 		 474 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  24.19 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  28.17 
 
 		 574 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.63 
 
 		 559 aa  60.1  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3047  beta-lactamase  28.64 
 
 		 464 aa  59.7  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3141  beta-lactamase  25.54 
 
 		 447 aa  59.3  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  30.57 
 
 		 475 aa  59.3  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  23.41 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  24.48 
 
 		 499 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  21.99 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  27.78 
 
 		 658 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  23.57 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  24.28 
 
 		 1055 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  25.32 
 
 		 822 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  22.85 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  28.57 
 
 		 514 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  27.51 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  30.1 
 
 		 713 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  26.3 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  30.33 
 
 		 650 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  27.07 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  23.79 
 
 		 453 aa  57  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  27.83 
 
 		 784 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1136  beta-lactamase  31.03 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0059  beta-lactamase  21.74 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>