57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0372 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0372  beta-lactamase  100 
 
 		 166 aa  331  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.499821  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  37.72 
 
 		 384 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  37.06 
 
 		 385 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  38.92 
 
 		 388 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  38.6 
 
 		 391 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  37.72 
 
 		 389 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  33.74 
 
 		 417 aa  97.8  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  32.56 
 
 		 394 aa  97.4  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  31.98 
 
 		 394 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  32.56 
 
 		 394 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  32.75 
 
 		 394 aa  96.7  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  37.13 
 
 		 389 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  32.56 
 
 		 394 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  33.33 
 
 		 405 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  31.25 
 
 		 401 aa  95.1  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  35.12 
 
 		 389 aa  93.6  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  33.13 
 
 		 417 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  34.13 
 
 		 389 aa  90.5  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  34.13 
 
 		 389 aa  90.5  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  34.13 
 
 		 389 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  38.22 
 
 		 383 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  32.74 
 
 		 396 aa  84.3  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  34.13 
 
 		 389 aa  84  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  31.68 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  32.97 
 
 		 387 aa  81.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  35.03 
 
 		 385 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  35.23 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  33.13 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  34.13 
 
 		 397 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  32.35 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  29.07 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  30.67 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  28.99 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  32.93 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  32.12 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  30.91 
 
 		 387 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  31.95 
 
 		 379 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  31.68 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  29.34 
 
 		 401 aa  64.7  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  29.94 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  29.34 
 
 		 380 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  29.34 
 
 		 380 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  27.72 
 
 		 381 aa  55.1  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  30 
 
 		 377 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  29.86 
 
 		 378 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  27.33 
 
 		 380 aa  51.6  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  28.97 
 
 		 377 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  27.72 
 
 		 409 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  27.72 
 
 		 409 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  28.19 
 
 		 377 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  27.52 
 
 		 377 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  28.86 
 
 		 377 aa  49.3  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  27.44 
 
 		 385 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  28.19 
 
 		 377 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  28.28 
 
 		 377 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  27.52 
 
 		 377 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  27.52 
 
 		 377 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>