More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0739 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  100 
 
 
381 aa  771    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  38.87 
 
 
378 aa  266  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4921  beta-lactamase  36.67 
 
 
386 aa  236  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.240852 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  37.11 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  35.82 
 
 
394 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  36.68 
 
 
397 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  35.82 
 
 
394 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  35.82 
 
 
394 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  35.45 
 
 
389 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1990  beta-lactamase  36.94 
 
 
405 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153808 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2388  beta-lactamase  35.22 
 
 
401 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  35.57 
 
 
394 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  36.53 
 
 
388 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2039  beta-lactamase  35.33 
 
 
417 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.285655  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  35.57 
 
 
394 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  36.68 
 
 
389 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  34.92 
 
 
389 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  34.99 
 
 
387 aa  222  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  36.68 
 
 
389 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  36.68 
 
 
389 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  34.79 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1937  beta-lactamase  34.69 
 
 
417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.87216  hitchhiker  0.0000051216 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  36.24 
 
 
389 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  33.94 
 
 
389 aa  219  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  37.06 
 
 
385 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  35.9 
 
 
377 aa  216  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  37.37 
 
 
391 aa  215  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  35.9 
 
 
377 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  34.21 
 
 
409 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  34.21 
 
 
409 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0743599 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  35.64 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  35.11 
 
 
377 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  34.93 
 
 
378 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.666233 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  34.84 
 
 
377 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  34.84 
 
 
377 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2695  beta-lactamase  35.11 
 
 
385 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  33.51 
 
 
383 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  34.57 
 
 
377 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0193  beta-lactamase  34.47 
 
 
387 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  33.6 
 
 
390 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  34.57 
 
 
377 aa  209  7e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  34.31 
 
 
377 aa  208  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  34.18 
 
 
397 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  33.51 
 
 
385 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  37.43 
 
 
388 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  35.51 
 
 
384 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  36.97 
 
 
383 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1481  beta-lactamase  34.44 
 
 
405 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.176782 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1775  beta-lactamase  35.16 
 
 
396 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0348744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2381  beta-lactamase  33.43 
 
 
379 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.713933  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  32.05 
 
 
380 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  31.78 
 
 
380 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2813  beta-lactamase  32.05 
 
 
380 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3749  beta-lactamase  31.99 
 
 
380 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  31.41 
 
 
401 aa  173  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5292  beta-lactamase  33.78 
 
 
315 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  28.53 
 
 
359 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  27.06 
 
 
359 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0388  Beta-lactamase  29.02 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  30.43 
 
 
494 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  26.81 
 
 
513 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  26.2 
 
 
513 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  25.97 
 
 
513 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  26.2 
 
 
513 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3141  beta-lactamase  26.36 
 
 
447 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  28.05 
 
 
669 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  30.33 
 
 
600 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  27.05 
 
 
544 aa  96.7  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  30.25 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  25.19 
 
 
404 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  30.25 
 
 
388 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  24.86 
 
 
485 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  25.14 
 
 
485 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  24.86 
 
 
485 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  25.63 
 
 
361 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  26.54 
 
 
461 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.31 
 
 
487 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0844  beta-lactam binding protein AmpH  28.84 
 
 
388 aa  94.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0659143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  26.8 
 
 
530 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  24.03 
 
 
485 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  24.03 
 
 
485 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  26.88 
 
 
385 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  26.88 
 
 
385 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  24.86 
 
 
485 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  30.74 
 
 
388 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  26.88 
 
 
385 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  26.88 
 
 
385 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  26.88 
 
 
385 aa  93.6  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  23.61 
 
 
498 aa  93.6  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  26.88 
 
 
385 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  26.88 
 
 
385 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  24.23 
 
 
453 aa  93.2  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00323  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  26.88 
 
 
385 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  28.36 
 
 
635 aa  93.2  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00327  hypothetical protein  26.88 
 
 
385 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  30.19 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  29.63 
 
 
285 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  29.03 
 
 
443 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.81 
 
 
388 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  24.26 
 
 
401 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>