More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2207 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  100 
 
 		 404 aa  838    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  46.91 
 
 		 491 aa  323  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  43.27 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  33.6 
 
 		 504 aa  207  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  33.42 
 
 		 352 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4667  beta-lactamase  32.93 
 
 		 498 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  32.52 
 
 		 494 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  29.18 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  27.93 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  28.19 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  28.79 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  28.94 
 
 		 401 aa  116  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0844  beta-lactam binding protein AmpH  28.65 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0659143 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2836  beta-lactam binding protein AmpH  27.73 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1447  beta-lactam binding protein AmpH  27.73 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000414942  normal  0.794569 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2758  beta-lactam binding protein AmpH  27.73 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277431  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  26.87 
 
 		 385 aa  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  26.87 
 
 		 385 aa  113  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  26.87 
 
 		 385 aa  113  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  26.87 
 
 		 385 aa  113  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  26.87 
 
 		 385 aa  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  26.87 
 
 		 385 aa  113  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  26.87 
 
 		 385 aa  113  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00323  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  27.68 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00327  hypothetical protein  27.68 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0417  beta-lactam binding protein AmpH  28.11 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.144637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.15 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  27.03 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  27.03 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0409  beta-lactam binding protein AmpH  27.81 
 
 		 385 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225371  hitchhiker  0.000170283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.46 
 
 		 487 aa  109  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0471  beta-lactam binding protein AmpH  27.38 
 
 		 385 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598882  normal  0.181498 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  26.39 
 
 		 377 aa  109  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0429  beta-lactam binding protein AmpH  27.51 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.524845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0411  beta-lactam binding protein AmpH  27.38 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  24.93 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  27 
 
 		 377 aa  106  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  28.84 
 
 		 498 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.83 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  28.84 
 
 		 498 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  27.27 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  27.27 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  27.55 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  28.36 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0636  beta-lactam binding protein AmpH  25.96 
 
 		 380 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.259822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  32.85 
 
 		 578 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  26.67 
 
 		 345 aa  102  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  26.43 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  26.56 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  26.7 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  26.56 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  27.49 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  27.27 
 
 		 657 aa  101  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  24.87 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  25.89 
 
 		 533 aa  100  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2550  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.72 
 
 		 489 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  27.09 
 
 		 388 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  25.8 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  26.65 
 
 		 407 aa  97.4  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  25.19 
 
 		 389 aa  96.3  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  25.56 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  26.6 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  25.19 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  25.8 
 
 		 505 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  24.28 
 
 		 514 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2947  beta-lactamase  25.21 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6651  beta-lactam binding protein AmpH  25.65 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  25.28 
 
 		 520 aa  94  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  29.43 
 
 		 434 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  26.72 
 
 		 440 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  26.64 
 
 		 677 aa  93.6  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  29.11 
 
 		 446 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  24.4 
 
 		 539 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.47 
 
 		 442 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  27.01 
 
 		 498 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  27.84 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  29.83 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  24.93 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  23.82 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  25.8 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  29.87 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  24.09 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  25.8 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  27.3 
 
 		 445 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  26.74 
 
 		 497 aa  90.1  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  25.9 
 
 		 848 aa  90.1  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  29.87 
 
 		 388 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.87 
 
 		 389 aa  89.7  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  29.87 
 
 		 388 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  25.26 
 
 		 390 aa  89.7  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  29.87 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  28.09 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2029  beta-lactamase  27.96 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.26 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.57 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  24 
 
 		 1032 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  25.89 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2038  beta-lactamase  26.45 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  25.43 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3476  beta-lactamase  25.33 
 
 		 474 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>