More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0951 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  100 
 
 		 345 aa  675    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  38.46 
 
 		 460 aa  169  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  33.64 
 
 		 494 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  35.26 
 
 		 401 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  33.64 
 
 		 498 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2550  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  36.09 
 
 		 489 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  30 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  39.38 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1136  beta-lactamase  37.24 
 
 		 357 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167829  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  29.09 
 
 		 359 aa  129  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  35.67 
 
 		 450 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  33.13 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  29.77 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  30.63 
 
 		 566 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  26.76 
 
 		 491 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  29.45 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3141  beta-lactamase  27.36 
 
 		 447 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  26.67 
 
 		 404 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3476  beta-lactamase  34.29 
 
 		 474 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6651  beta-lactam binding protein AmpH  32.79 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1258  beta-lactamase  38.38 
 
 		 377 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.775815  normal  0.0157714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  29.81 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.8 
 
 		 453 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.27 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  30.56 
 
 		 461 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  32.1 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  27.45 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  27.22 
 
 		 485 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  27.14 
 
 		 377 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  31.03 
 
 		 650 aa  97.1  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  27.07 
 
 		 377 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  27.35 
 
 		 377 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  27.43 
 
 		 377 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  27.07 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  31.18 
 
 		 451 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  27.07 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  29.51 
 
 		 595 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  27.35 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  28.35 
 
 		 485 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  27.46 
 
 		 352 aa  94  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  27.14 
 
 		 377 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3364  beta-lactamase  27.89 
 
 		 385 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  27.14 
 
 		 377 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  30.42 
 
 		 717 aa  93.2  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  28 
 
 		 485 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  31.16 
 
 		 437 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  28.2 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  27.43 
 
 		 485 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  28.01 
 
 		 533 aa  90.9  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  30.59 
 
 		 464 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  27.16 
 
 		 485 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  29.66 
 
 		 588 aa  90.1  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  24.11 
 
 		 485 aa  89.7  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  25.68 
 
 		 381 aa  88.6  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  27.3 
 
 		 485 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00323  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  25.55 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  25.24 
 
 		 385 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  25.24 
 
 		 385 aa  87.8  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  25.24 
 
 		 385 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  25.24 
 
 		 385 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  25.24 
 
 		 385 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00327  hypothetical protein  25.55 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  25.24 
 
 		 385 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  30.13 
 
 		 655 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  25.24 
 
 		 385 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  25.32 
 
 		 462 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  30.14 
 
 		 778 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.07 
 
 		 453 aa  87.4  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1770  beta-lactamase  35.28 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.511709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  32.46 
 
 		 476 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  26.54 
 
 		 485 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  26.54 
 
 		 485 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.6 
 
 		 544 aa  86.7  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5304  beta-lactamase  32.75 
 
 		 513 aa  86.3  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  28.45 
 
 		 620 aa  86.3  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  26.05 
 
 		 446 aa  86.3  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  25.17 
 
 		 504 aa  86.3  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  31 
 
 		 416 aa  86.3  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  29.41 
 
 		 566 aa  85.9  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2758  beta-lactam binding protein AmpH  24.58 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277431  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2836  beta-lactam binding protein AmpH  24.58 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1447  beta-lactam binding protein AmpH  24.92 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000414942  normal  0.794569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  26.35 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  26.22 
 
 		 485 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.48 
 
 		 559 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0844  beta-lactam binding protein AmpH  25.95 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0659143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  28.32 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  26.99 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0636  beta-lactam binding protein AmpH  26.25 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.259822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  30 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000462  beta-lactamase  24.7 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.774984  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  25.07 
 
 		 501 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  29.07 
 
 		 523 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  26.4 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  28.1 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  29.65 
 
 		 485 aa  82.8  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.72 
 
 		 582 aa  82.8  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  26.76 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  26.76 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  28.78 
 
 		 547 aa  82.8  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>