283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1770 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1770  beta-lactamase  100 
 
 		 338 aa  629  1e-179  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.511709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  34.86 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  29.27 
 
 		 494 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  29.81 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  28.5 
 
 		 566 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2550  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.37 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  26.98 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  26.32 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  24.22 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  26.32 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  31.4 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  23.76 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  31.4 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  28.79 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  23.55 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1136  beta-lactamase  30.84 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  24.09 
 
 		 537 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  26.61 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  32.42 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  27.91 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  33.33 
 
 		 601 aa  59.3  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3141  beta-lactamase  30.56 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  32.48 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0928  beta-lactam binding protein AmpH  32.19 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.033671 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  34.43 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.44 
 
 		 582 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  32.03 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  27.09 
 
 		 848 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  24.92 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  26.86 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  28.06 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  32.71 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  26.21 
 
 		 464 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  23.26 
 
 		 364 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  28.27 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1258  beta-lactamase  34.29 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.775815  normal  0.0157714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  33.61 
 
 		 530 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  29.61 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00323  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  27.57 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  27.57 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  21.71 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00327  hypothetical protein  27.57 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  30.1 
 
 		 784 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  27.57 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  27.57 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  27.57 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  26.59 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  27.57 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.14 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  22.98 
 
 		 533 aa  54.3  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  27.57 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  29.13 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  27.57 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  32.5 
 
 		 462 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.55 
 
 		 595 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  29 
 
 		 560 aa  53.9  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1900  beta-lactamase  33.33 
 
 		 297 aa  53.9  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  27.38 
 
 		 369 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2708  beta-lactamase  30.33 
 
 		 417 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  25.33 
 
 		 691 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  23.11 
 
 		 511 aa  53.5  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1447  beta-lactam binding protein AmpH  27.1 
 
 		 383 aa  53.5  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000414942  normal  0.794569 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  30.92 
 
 		 966 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  30.51 
 
 		 5698 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  25.33 
 
 		 691 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  24.51 
 
 		 389 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  46.15 
 
 		 479 aa  53.5  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  26.05 
 
 		 591 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2758  beta-lactam binding protein AmpH  27.1 
 
 		 388 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277431  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2836  beta-lactam binding protein AmpH  27.1 
 
 		 388 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  22.63 
 
 		 415 aa  53.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  31.31 
 
 		 792 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  27.94 
 
 		 364 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  29.73 
 
 		 513 aa  53.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  24.21 
 
 		 513 aa  52.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  25.73 
 
 		 793 aa  52.8  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  25.8 
 
 		 513 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  24.56 
 
 		 513 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  25.91 
 
 		 356 aa  52.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  22.9 
 
 		 405 aa  52.8  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.77 
 
 		 559 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2236  beta-lactamase  21.67 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  23.77 
 
 		 443 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  28.57 
 
 		 588 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  26.13 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  26.38 
 
 		 422 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3450  beta-lactamase  34.36 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  29.06 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.46 
 
 		 484 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  26.95 
 
 		 476 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2357  beta-lactamase  28.67 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  30.92 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  24.88 
 
 		 381 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0417  beta-lactam binding protein AmpH  26.03 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.144637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0409  beta-lactam binding protein AmpH  26.03 
 
 		 385 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225371  hitchhiker  0.000170283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  26.13 
 
 		 461 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0471  beta-lactam binding protein AmpH  26.03 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598882  normal  0.181498 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  29.23 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0411  beta-lactam binding protein AmpH  26.03 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  27.49 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>