More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2357 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2357  beta-lactamase  100 
 
 
368 aa  736    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1021  beta-lactamase  45.07 
 
 
353 aa  219  6e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.627803  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1951  beta-lactamase  38.37 
 
 
369 aa  213  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1219  beta-lactamase  27.7 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.705817  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  27.93 
 
 
523 aa  109  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  25.2 
 
 
513 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  27.59 
 
 
437 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.74 
 
 
544 aa  102  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5525  beta-lactamase  26.71 
 
 
357 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434559  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  34.93 
 
 
459 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  29.17 
 
 
464 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  26.72 
 
 
461 aa  96.3  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  25.33 
 
 
517 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  30.56 
 
 
517 aa  92.8  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  24.87 
 
 
529 aa  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  24.04 
 
 
803 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  31.14 
 
 
497 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  25.07 
 
 
566 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  26.69 
 
 
530 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.89 
 
 
388 aa  90.1  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.63 
 
 
388 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.31 
 
 
411 aa  89.7  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  28.32 
 
 
449 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.49 
 
 
484 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  26.67 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  23.64 
 
 
475 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  24.8 
 
 
514 aa  87  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  25 
 
 
388 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  33 
 
 
392 aa  85.9  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  26.03 
 
 
378 aa  86.3  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  23.21 
 
 
485 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.43 
 
 
595 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  25.96 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  27.35 
 
 
460 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  26.79 
 
 
466 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.09 
 
 
508 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  27.33 
 
 
519 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4430  beta-lactamase  33.33 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  33.04 
 
 
462 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  29.71 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  23.77 
 
 
526 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  26.7 
 
 
566 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  24.43 
 
 
482 aa  84  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  24.44 
 
 
446 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  27.35 
 
 
483 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  28.04 
 
 
499 aa  83.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  27.62 
 
 
456 aa  83.2  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  29.26 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  26.47 
 
 
485 aa  83.6  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  31 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  25.43 
 
 
388 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  25.87 
 
 
388 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25.87 
 
 
389 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  25.87 
 
 
388 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  21.78 
 
 
385 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  27.03 
 
 
519 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  25.43 
 
 
388 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  27.66 
 
 
356 aa  82.8  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  25.2 
 
 
443 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  24.66 
 
 
385 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  24.24 
 
 
1032 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  27.11 
 
 
406 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  27.78 
 
 
567 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  27.27 
 
 
446 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  29.8 
 
 
530 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  25.75 
 
 
483 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  28.94 
 
 
547 aa  81.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  22.52 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.14 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  26.93 
 
 
503 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  32.04 
 
 
603 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0278  beta-lactamase  29.74 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  25.44 
 
 
822 aa  80.1  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  31.49 
 
 
611 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  25.24 
 
 
533 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  31.61 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  23.24 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  21.54 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.47 
 
 
442 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  29.74 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  31.49 
 
 
593 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  22.51 
 
 
482 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0398  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.78 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8159  alkaline D-peptidase  30.5 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.533807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  24.13 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  22.43 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  24.33 
 
 
453 aa  79  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  29.44 
 
 
478 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  25.71 
 
 
497 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  28.79 
 
 
526 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  31.91 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  22.51 
 
 
482 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  25.41 
 
 
550 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  28.61 
 
 
455 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  22.19 
 
 
485 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  23.36 
 
 
485 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  26.63 
 
 
480 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  29.48 
 
 
695 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  21.25 
 
 
384 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  26.46 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>