More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0116 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  100 
 
 
453 aa  912    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  33.48 
 
 
466 aa  239  8e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  32.11 
 
 
486 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  32.55 
 
 
595 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  27.85 
 
 
485 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  28.57 
 
 
485 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  31.25 
 
 
487 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  28.57 
 
 
485 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  28.57 
 
 
485 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  27.01 
 
 
485 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  27.47 
 
 
485 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  27.75 
 
 
485 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  27.98 
 
 
485 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  27.06 
 
 
485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  31.1 
 
 
498 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  27.08 
 
 
485 aa  147  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  28.35 
 
 
524 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  30.25 
 
 
601 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  31.36 
 
 
401 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  27.36 
 
 
588 aa  140  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  25.97 
 
 
485 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  28.9 
 
 
590 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  28.91 
 
 
1055 aa  137  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  29.79 
 
 
669 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  29.49 
 
 
513 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  29.34 
 
 
513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  28.38 
 
 
566 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  28.97 
 
 
498 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  27.81 
 
 
567 aa  134  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  28.97 
 
 
498 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  29.11 
 
 
446 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  29.25 
 
 
547 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  29.06 
 
 
513 aa  132  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  29.53 
 
 
1032 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  27.94 
 
 
434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  28.48 
 
 
537 aa  130  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  28.92 
 
 
477 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  25.22 
 
 
591 aa  129  9.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  28.57 
 
 
481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  28.93 
 
 
513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  27.49 
 
 
482 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  29.22 
 
 
481 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  27.96 
 
 
463 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  29.22 
 
 
481 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  27.54 
 
 
377 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  27.33 
 
 
559 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  23.66 
 
 
505 aa  126  8.000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  30.64 
 
 
478 aa  126  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  29.77 
 
 
635 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  27.19 
 
 
482 aa  126  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  25.66 
 
 
501 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  26.16 
 
 
384 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.48 
 
 
392 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  28.03 
 
 
483 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  27.88 
 
 
483 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  26.58 
 
 
578 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  27.54 
 
 
481 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  29.59 
 
 
513 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  27.38 
 
 
342 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  28.03 
 
 
490 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  26.77 
 
 
530 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  27.65 
 
 
822 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  29.52 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  26.5 
 
 
600 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  26.71 
 
 
616 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.23 
 
 
514 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  29.28 
 
 
451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  29.52 
 
 
405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  26.9 
 
 
475 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.31 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  28.92 
 
 
405 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  26.82 
 
 
533 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  26.18 
 
 
543 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.53 
 
 
480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  26.8 
 
 
513 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  30 
 
 
450 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  30 
 
 
553 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  28.57 
 
 
633 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.45 
 
 
362 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  26.3 
 
 
650 aa  117  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  29.43 
 
 
470 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  28.22 
 
 
338 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  29.8 
 
 
414 aa  117  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  27.57 
 
 
497 aa  117  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  26.05 
 
 
365 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  29.52 
 
 
405 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  27.03 
 
 
496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  29.73 
 
 
363 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  27.06 
 
 
543 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  27.06 
 
 
543 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  25.82 
 
 
499 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  27.01 
 
 
620 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  27.25 
 
 
593 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  28.15 
 
 
614 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  27.79 
 
 
611 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.42 
 
 
529 aa  113  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  26.63 
 
 
464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.67 
 
 
544 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  27.68 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  29.97 
 
 
430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>