162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5525 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5525  beta-lactamase  100 
 
 		 357 aa  740    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434559  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1219  beta-lactamase  45.18 
 
 		 357 aa  320  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.705817  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1951  beta-lactamase  28.37 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2357  beta-lactamase  26.71 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  23.99 
 
 		 526 aa  79.7  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  22.97 
 
 		 567 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  24.19 
 
 		 544 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  24.14 
 
 		 523 aa  69.7  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  27.17 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  22.35 
 
 		 485 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  21.59 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  23.01 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  23.66 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  26.52 
 
 		 520 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  21.68 
 
 		 513 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  25.43 
 
 		 461 aa  62.8  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  23.88 
 
 		 467 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  22.32 
 
 		 485 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  22.35 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.45 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  23.17 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  25.6 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  21.55 
 
 		 485 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  26.82 
 
 		 614 aa  59.7  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  29.63 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  29.81 
 
 		 530 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  26.6 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  23.57 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  28 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  24.06 
 
 		 822 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  26.37 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  28.16 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  31.3 
 
 		 464 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  29.25 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  24.18 
 
 		 803 aa  56.2  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  23.39 
 
 		 477 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.85 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  20.57 
 
 		 485 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  23.46 
 
 		 481 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  21.2 
 
 		 485 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  27.01 
 
 		 499 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  24.57 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  21.2 
 
 		 485 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  23.46 
 
 		 481 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  23.46 
 
 		 463 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  21.2 
 
 		 485 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  23.46 
 
 		 481 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  21.91 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  23.33 
 
 		 455 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  20.57 
 
 		 485 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  21.67 
 
 		 519 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  33.64 
 
 		 547 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  21.05 
 
 		 591 aa  53.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  24.19 
 
 		 2457 aa  53.5  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  27.78 
 
 		 655 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  25.41 
 
 		 466 aa  53.5  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  23.46 
 
 		 481 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  22.44 
 
 		 519 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  26.67 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  27.45 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.51 
 
 		 413 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  20.92 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.97 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  26.4 
 
 		 544 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  24.92 
 
 		 547 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  22.78 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  21.67 
 
 		 550 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.53 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  23.53 
 
 		 620 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.06 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  24.1 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  21.59 
 
 		 456 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  22.96 
 
 		 486 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  27.63 
 
 		 603 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  25 
 
 		 720 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  23.47 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.67 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  27.03 
 
 		 519 aa  50.4  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  24.85 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  24.85 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  24.85 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  25.84 
 
 		 416 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  22.91 
 
 		 490 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  25.6 
 
 		 388 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  25.07 
 
 		 5698 aa  50.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  28.16 
 
 		 531 aa  50.1  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  20.71 
 
 		 497 aa  49.7  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  26.97 
 
 		 529 aa  50.1  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  21.64 
 
 		 483 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  24.66 
 
 		 562 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  24.72 
 
 		 447 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  21.23 
 
 		 483 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  21.5 
 
 		 530 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1021  beta-lactamase  25.76 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.627803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  26.19 
 
 		 566 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  26.8 
 
 		 455 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  26.21 
 
 		 536 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  29.87 
 
 		 385 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  21.34 
 
 		 445 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  25.23 
 
 		 533 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>