More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1134 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  100 
 
 		 603 aa  1250    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  42.05 
 
 		 591 aa  461  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  30.23 
 
 		 566 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  35.23 
 
 		 485 aa  274  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  33.18 
 
 		 485 aa  273  9e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  33.41 
 
 		 485 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  33.41 
 
 		 485 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  33.41 
 
 		 485 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  32.72 
 
 		 485 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  32.95 
 
 		 485 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  32.95 
 
 		 485 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  32.95 
 
 		 485 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  33.71 
 
 		 485 aa  267  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  33.41 
 
 		 485 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  29.24 
 
 		 567 aa  234  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  32 
 
 		 526 aa  200  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  29.27 
 
 		 497 aa  197  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  29.91 
 
 		 513 aa  195  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  30.44 
 
 		 499 aa  191  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  27.92 
 
 		 822 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  29.85 
 
 		 520 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  26.95 
 
 		 517 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  27.76 
 
 		 519 aa  179  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  28.26 
 
 		 544 aa  179  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  27.01 
 
 		 803 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  25.44 
 
 		 526 aa  163  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  27.56 
 
 		 503 aa  162  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  27.87 
 
 		 530 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  27.57 
 
 		 519 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.04 
 
 		 529 aa  154  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  31.75 
 
 		 455 aa  152  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  27.2 
 
 		 519 aa  151  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  26.02 
 
 		 523 aa  150  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  26.8 
 
 		 455 aa  147  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  26.8 
 
 		 455 aa  147  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  27 
 
 		 466 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  26.65 
 
 		 578 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  30.09 
 
 		 551 aa  138  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  30.12 
 
 		 531 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  27.73 
 
 		 533 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  27.93 
 
 		 447 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  26.2 
 
 		 531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  27.72 
 
 		 544 aa  135  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  27.34 
 
 		 533 aa  134  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  24.8 
 
 		 620 aa  134  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  29.52 
 
 		 485 aa  133  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  30.86 
 
 		 566 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  29.34 
 
 		 588 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.82 
 
 		 601 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  28.04 
 
 		 550 aa  130  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  26.88 
 
 		 547 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  27.92 
 
 		 531 aa  128  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  26.7 
 
 		 562 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  29.14 
 
 		 498 aa  127  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  27.12 
 
 		 533 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  27.12 
 
 		 533 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  27.12 
 
 		 533 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  26.12 
 
 		 399 aa  125  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  26.75 
 
 		 655 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  27.79 
 
 		 536 aa  123  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  24.74 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  24.74 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  24.46 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.04 
 
 		 595 aa  121  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  28 
 
 		 342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  25.13 
 
 		 486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  25.89 
 
 		 519 aa  119  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  26.81 
 
 		 445 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.6 
 
 		 487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  27.11 
 
 		 517 aa  115  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  25 
 
 		 453 aa  114  6e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  23.59 
 
 		 505 aa  114  8.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  22.25 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  28.15 
 
 		 356 aa  112  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.66 
 
 		 480 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  28.27 
 
 		 637 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  24.92 
 
 		 385 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  24.73 
 
 		 470 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  25.56 
 
 		 462 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  25.4 
 
 		 401 aa  110  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  22.31 
 
 		 462 aa  110  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  25.16 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  25.77 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  25.58 
 
 		 496 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  23.84 
 
 		 551 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  25.19 
 
 		 1032 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  24.6 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  25.94 
 
 		 524 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  26.6 
 
 		 533 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  27.13 
 
 		 442 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  26.46 
 
 		 559 aa  104  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  26.78 
 
 		 513 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  24.68 
 
 		 389 aa  104  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  24.74 
 
 		 446 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  25.53 
 
 		 380 aa  104  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  24.93 
 
 		 669 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  25.92 
 
 		 362 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  27 
 
 		 525 aa  103  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  25.67 
 
 		 658 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0563  beta-lactamase  26.01 
 
 		 506 aa  103  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000636485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>